More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1814 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  66.33 
 
 		 502 aa  705    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  63.98 
 
 		 500 aa  682    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  63.78 
 
 		 509 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  63.91 
 
 		 501 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  64.24 
 
 		 509 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.99 
 
 		 501 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.31 
 
 		 500 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  62.85 
 
 		 507 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  84.98 
 
 		 507 aa  904    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.24 
 
 		 509 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 		 507 aa  1048    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  62.85 
 
 		 507 aa  642    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.03 
 
 		 502 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  64.31 
 
 		 500 aa  685    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  67.47 
 
 		 500 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  84.81 
 
 		 507 aa  898    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  61.52 
 
 		 497 aa  621  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  58.81 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  58.66 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  58.32 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  58.95 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.12 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.14 
 
 		 503 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  57.37 
 
 		 503 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  57.06 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  55.35 
 
 		 503 aa  559  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  55.15 
 
 		 505 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  56.57 
 
 		 510 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  56.97 
 
 		 502 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  42.66 
 
 		 747 aa  307  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.76 
 
 		 712 aa  304  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  49.53 
 
 		 741 aa  292  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  39.27 
 
 		 681 aa  271  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.19 
 
 		 693 aa  269  7e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  39.44 
 
 		 685 aa  268  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  46.39 
 
 		 684 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.23 
 
 		 1519 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  44 
 
 		 1510 aa  246  9e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.27 
 
 		 1533 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  43.75 
 
 		 1554 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  44.16 
 
 		 1546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.41 
 
 		 1505 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 		 1485 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 1484 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 1477 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.6 
 
 		 1512 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  37.6 
 
 		 1512 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  39.35 
 
 		 1478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  38.23 
 
 		 1486 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  39.26 
 
 		 1515 aa  226  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.01 
 
 		 1524 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.73 
 
 		 1487 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  42.51 
 
 		 1513 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  41.19 
 
 		 1530 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  40.82 
 
 		 1516 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.61 
 
 		 1567 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  37.07 
 
 		 1512 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 1507 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  41.14 
 
 		 1516 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 1460 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  40 
 
 		 1489 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  39.33 
 
 		 1478 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  39.27 
 
 		 1477 aa  224  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  37.57 
 
 		 1487 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  39.75 
 
 		 1512 aa  224  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 1486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.95 
 
 		 1577 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.14 
 
 		 1511 aa  223  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 1462 aa  223  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 1486 aa  223  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 1486 aa  223  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  38.18 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.38 
 
 		 1518 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.4 
 
 		 1510 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  38.18 
 
 		 1478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  39.02 
 
 		 1478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 1482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1469 aa  221  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.78 
 
 		 1489 aa  221  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.42 
 
 		 1527 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.74 
 
 		 1468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 1487 aa  220  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.97 
 
 		 1572 aa  220  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1526 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  37.11 
 
 		 1533 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 1486 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  38.97 
 
 		 1572 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 		 1499 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 		 1499 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.03 
 
 		 1483 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 1487 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 1485 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  39.81 
 
 		 1516 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.08 
 
 		 1526 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 1535 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>