More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1741 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 747 aa  1514    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  49.47 
 
 		 741 aa  682    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  72.87 
 
 		 712 aa  1086    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  41.82 
 
 		 685 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  41.76 
 
 		 681 aa  492  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.85 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  41.16 
 
 		 684 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  51.15 
 
 		 502 aa  331  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  44.57 
 
 		 510 aa  327  7e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  44.16 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.11 
 
 		 503 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  48.04 
 
 		 505 aa  320  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  49.04 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  46.05 
 
 		 503 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  51.2 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  50.14 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  52.4 
 
 		 530 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  43.06 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  48.9 
 
 		 503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  50.9 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.14 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.7 
 
 		 501 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  44.14 
 
 		 500 aa  310  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  50.72 
 
 		 502 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  51.67 
 
 		 500 aa  310  8e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.66 
 
 		 507 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  50.6 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  50.29 
 
 		 507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  42.43 
 
 		 507 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  44.6 
 
 		 501 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  50.43 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.13 
 
 		 502 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  48.13 
 
 		 507 aa  298  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  48.13 
 
 		 507 aa  298  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  50.6 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  49.85 
 
 		 510 aa  288  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.66 
 
 		 1510 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.13 
 
 		 1533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.75 
 
 		 1505 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  39.51 
 
 		 1478 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.81 
 
 		 1510 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.25 
 
 		 1483 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1516 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 		 1499 aa  194  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 		 1499 aa  194  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  34.81 
 
 		 1507 aa  193  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  34.83 
 
 		 1510 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.48 
 
 		 1567 aa  193  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.92 
 
 		 1512 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  39.2 
 
 		 1478 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.68 
 
 		 1519 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.8 
 
 		 1524 aa  193  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.29 
 
 		 1510 aa  193  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  38.92 
 
 		 1512 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  38.54 
 
 		 2126 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  39.2 
 
 		 1478 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  39.23 
 
 		 1485 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  39.38 
 
 		 1478 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.91 
 
 		 1550 aa  192  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  39.48 
 
 		 1546 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2319  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.1 
 
 		 1524 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.189899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  38.34 
 
 		 1530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  38.89 
 
 		 1478 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  35.2 
 
 		 1478 aa  191  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  37.97 
 
 		 1512 aa  191  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  38.89 
 
 		 1478 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  38.92 
 
 		 1535 aa  191  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  38.89 
 
 		 1478 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  38.89 
 
 		 1478 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  38.89 
 
 		 1478 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  38.49 
 
 		 1512 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.1 
 
 		 1513 aa  190  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  35.26 
 
 		 1516 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  35.26 
 
 		 1516 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.29 
 
 		 1527 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.97 
 
 		 1511 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  38.83 
 
 		 1554 aa  190  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.1 
 
 		 1511 aa  190  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.68 
 
 		 1525 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.31 
 
 		 1487 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  37.96 
 
 		 1477 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.18 
 
 		 492 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  33.18 
 
 		 1508 aa  189  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.25 
 
 		 1518 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.61 
 
 		 1546 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.66 
 
 		 1469 aa  188  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.54 
 
 		 1539 aa  188  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 1507 aa  187  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.67 
 
 		 1519 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  33.09 
 
 		 1540 aa  187  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  35.19 
 
 		 1569 aa  187  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.94 
 
 		 1509 aa  187  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  36.72 
 
 		 1510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.42 
 
 		 1527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.68 
 
 		 1558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  34.48 
 
 		 1498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.07 
 
 		 1577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 1487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 1487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 		 1525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>