More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1802 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  49.64 
 
 
1510 aa  1350    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  48.54 
 
 
1478 aa  1336    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  48.2 
 
 
1478 aa  1326    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  48.37 
 
 
1478 aa  1329    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  48.34 
 
 
1478 aa  1325    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  48 
 
 
1478 aa  1329    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  47.81 
 
 
1478 aa  1313    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.94 
 
 
1519 aa  1271    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  48.29 
 
 
1513 aa  1304    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  48.37 
 
 
1478 aa  1329    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  50.3 
 
 
1510 aa  1362    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  48.3 
 
 
1478 aa  1326    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  51.42 
 
 
1507 aa  1370    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  47.87 
 
 
1478 aa  1313    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  84.05 
 
 
1518 aa  2601    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.3 
 
 
1505 aa  1352    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  48.44 
 
 
1478 aa  1336    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.08 
 
 
1510 aa  1257    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.56 
 
 
1499 aa  1249    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  49.07 
 
 
1507 aa  1300    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 
1498 aa  3023    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  47.8 
 
 
1477 aa  1318    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  32.97 
 
 
1482 aa  572  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  32.02 
 
 
1482 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  31.95 
 
 
1482 aa  560  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.89 
 
 
1482 aa  556  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  31.7 
 
 
1482 aa  552  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.86 
 
 
1482 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  31.81 
 
 
1482 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.13 
 
 
1482 aa  549  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  31.64 
 
 
1482 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31.3 
 
 
1482 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  31.3 
 
 
1482 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  32.17 
 
 
1482 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.83 
 
 
1482 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  31.78 
 
 
1483 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 
1486 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  31.41 
 
 
1462 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  30.84 
 
 
1487 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.27 
 
 
1486 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.2 
 
 
1487 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.55 
 
 
1525 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  31.48 
 
 
1571 aa  536  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  31.41 
 
 
1462 aa  536  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  32.02 
 
 
1483 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.22 
 
 
1487 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.99 
 
 
1526 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  31.5 
 
 
1486 aa  529  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  31.97 
 
 
1484 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.37 
 
 
1474 aa  530  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 
1519 aa  526  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  31.69 
 
 
1486 aa  525  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  32.23 
 
 
1507 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  31.35 
 
 
1486 aa  525  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.16 
 
 
1511 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.8 
 
 
1548 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 
1481 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.3 
 
 
1489 aa  523  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  31.07 
 
 
1530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 
1489 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.63 
 
 
1554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  31.15 
 
 
1482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  31.61 
 
 
1485 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  31.29 
 
 
1562 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  31.56 
 
 
1485 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.15 
 
 
1486 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  31.83 
 
 
1508 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  31.38 
 
 
1546 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  31.07 
 
 
1477 aa  516  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  31.38 
 
 
1535 aa  516  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.59 
 
 
1554 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  31.17 
 
 
1554 aa  516  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  30.31 
 
 
1515 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  30.08 
 
 
1481 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  30.28 
 
 
1486 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.84 
 
 
1524 aa  512  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.67 
 
 
1519 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  31.55 
 
 
1546 aa  513  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  31.44 
 
 
1582 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.21 
 
 
1527 aa  512  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  29.66 
 
 
1533 aa  513  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  31.27 
 
 
1480 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.71 
 
 
1520 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  30.89 
 
 
1536 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  31.76 
 
 
1485 aa  509  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  29.66 
 
 
1460 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  29.89 
 
 
1526 aa  508  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  31.3 
 
 
1481 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  30.21 
 
 
1481 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  30.82 
 
 
1486 aa  506  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.8 
 
 
1501 aa  506  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  30.55 
 
 
1583 aa  506  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  29.99 
 
 
1481 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  30.04 
 
 
1516 aa  506  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.61 
 
 
1520 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  30.23 
 
 
1481 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  31.67 
 
 
1516 aa  506  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  30.27 
 
 
1481 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  30.55 
 
 
1583 aa  506  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3875  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.1 
 
 
1566 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>