More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1239 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.6 
 
 		 501 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  60.12 
 
 		 500 aa  650    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  100 
 
 		 509 aa  1050    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  61.24 
 
 		 507 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  63.86 
 
 		 501 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  61.24 
 
 		 507 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  64.26 
 
 		 500 aa  682    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  94.3 
 
 		 509 aa  962    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.78 
 
 		 507 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  61.65 
 
 		 502 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  63.78 
 
 		 507 aa  713    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  60.32 
 
 		 500 aa  652    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  91.36 
 
 		 509 aa  934    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  66.73 
 
 		 502 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  60.32 
 
 		 500 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  65.16 
 
 		 507 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  59.52 
 
 		 497 aa  634  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  56.49 
 
 		 530 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  54.67 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.51 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  54.47 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  54.47 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  55.67 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  55.42 
 
 		 503 aa  569  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  55.33 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  54.64 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  54.66 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  55.33 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  52.02 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  47.24 
 
 		 747 aa  315  9e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.56 
 
 		 712 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  48.67 
 
 		 741 aa  297  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  41.75 
 
 		 681 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  41.36 
 
 		 685 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.73 
 
 		 693 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  46.03 
 
 		 684 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  45 
 
 		 1519 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.41 
 
 		 1510 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  41.37 
 
 		 1524 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.69 
 
 		 1577 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.66 
 
 		 1505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  39.04 
 
 		 1546 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.69 
 
 		 1572 aa  239  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  41.69 
 
 		 1572 aa  239  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  41.38 
 
 		 1477 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  42.49 
 
 		 1478 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  39.46 
 
 		 1554 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 		 1564 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  44.21 
 
 		 1478 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.19 
 
 		 1509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  42.68 
 
 		 1563 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.89 
 
 		 1574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 1482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  43.31 
 
 		 1571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 1485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 1535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.43 
 
 		 1574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  43.03 
 
 		 1478 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 1485 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.71 
 
 		 1575 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  43.9 
 
 		 1478 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  39.77 
 
 		 1574 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  43.33 
 
 		 1478 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  40.06 
 
 		 1573 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  41.36 
 
 		 1478 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  44.05 
 
 		 1482 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  43.33 
 
 		 1478 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  43.33 
 
 		 1478 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  43.33 
 
 		 1478 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  43.03 
 
 		 1478 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  39.94 
 
 		 1580 aa  233  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 1488 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  38.86 
 
 		 1516 aa  233  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  40.24 
 
 		 1583 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 1507 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  39.03 
 
 		 1596 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.71 
 
 		 1573 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  39.88 
 
 		 1567 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.07 
 
 		 1483 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  42.55 
 
 		 1486 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 1487 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.69 
 
 		 1579 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 1487 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  40 
 
 		 1487 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 		 1583 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 		 1487 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 		 1583 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.99 
 
 		 1582 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1138  glutamate synthase (ferredoxin)  38.87 
 
 		 1587 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  38.42 
 
 		 1510 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  40 
 
 		 1574 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 1486 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 1486 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 1491 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.99 
 
 		 1578 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 1486 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3033  glutamate synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 1485 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.72 
 
 		 1469 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  40.62 
 
 		 1516 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  40.06 
 
 		 1515 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>