More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2709 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  66.6 
 
 		 510 aa  691    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  78.88 
 
 		 503 aa  837    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  67 
 
 		 510 aa  690    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  78.93 
 
 		 503 aa  828    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  73.71 
 
 		 505 aa  784    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 502 aa  1029    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  66.21 
 
 		 510 aa  662    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  67.19 
 
 		 510 aa  690    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  69.17 
 
 		 510 aa  724    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  78.53 
 
 		 502 aa  803    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  81.27 
 
 		 503 aa  854    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  57.09 
 
 		 530 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  58.5 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  59.24 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  58.1 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  55.11 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  58.8 
 
 		 507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.31 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  58.8 
 
 		 507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  54.91 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.06 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  57.61 
 
 		 507 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.91 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  54.89 
 
 		 501 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  57.29 
 
 		 501 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  56.03 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  55.33 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  55.22 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.85 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  51.15 
 
 		 747 aa  331  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.55 
 
 		 712 aa  327  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  43.22 
 
 		 741 aa  313  5.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  41.82 
 
 		 685 aa  296  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  42.29 
 
 		 681 aa  294  3e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.51 
 
 		 693 aa  283  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  39.95 
 
 		 684 aa  276  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.13 
 
 		 1510 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.47 
 
 		 1510 aa  223  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.03 
 
 		 1533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  40.69 
 
 		 1515 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 		 1519 aa  220  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.67 
 
 		 1567 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  39.4 
 
 		 1516 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  39.1 
 
 		 1516 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  42.28 
 
 		 1533 aa  217  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 		 1478 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  35.82 
 
 		 1478 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  35.82 
 
 		 1478 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  41.16 
 
 		 1478 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  35.82 
 
 		 1478 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  36.27 
 
 		 1478 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  35.82 
 
 		 1478 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  35.82 
 
 		 1478 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  36.27 
 
 		 1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.98 
 
 		 1505 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  40.85 
 
 		 1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.94 
 
 		 1511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  39.33 
 
 		 1477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.52 
 
 		 1577 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  40.38 
 
 		 1530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  35.83 
 
 		 1485 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  39.82 
 
 		 1572 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.39 
 
 		 1524 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.82 
 
 		 1572 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 1486 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1491 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 1482 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.53 
 
 		 1512 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  41.03 
 
 		 1546 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.36 
 
 		 1518 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  39.08 
 
 		 1510 aa  210  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.44 
 
 		 1539 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.62 
 
 		 1558 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 1460 aa  210  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  40.75 
 
 		 1526 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  39.13 
 
 		 1518 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 1482 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1481 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 1482 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3198  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.87 
 
 		 1518 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1482 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  38.29 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  38.87 
 
 		 1564 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.38 
 
 		 1554 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.39 
 
 		 510 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 1482 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3033  glutamate synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 1485 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  40.06 
 
 		 1482 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 1487 aa  208  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  38.11 
 
 		 1583 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1481 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1487 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2529  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.87 
 
 		 1536 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1481 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  39.29 
 
 		 1583 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 1481 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  39.29 
 
 		 1583 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>