More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1079 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  99.02 
 
 		 510 aa  1046    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  70.33 
 
 		 503 aa  734    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  88.82 
 
 		 510 aa  909    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  68.96 
 
 		 503 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  98.63 
 
 		 510 aa  1041    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  83.53 
 
 		 510 aa  882    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  67.13 
 
 		 503 aa  691    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  66.6 
 
 		 502 aa  691    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  63.37 
 
 		 505 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  65.74 
 
 		 502 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 510 aa  1053    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  60.12 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.66 
 
 		 507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  58.65 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.69 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  58.38 
 
 		 507 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  57.93 
 
 		 500 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.94 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  56.66 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.47 
 
 		 500 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  55.88 
 
 		 500 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  58.71 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  58.71 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  55.69 
 
 		 500 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  58.71 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  55.6 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  54.67 
 
 		 509 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  57.09 
 
 		 509 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.64 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  50.14 
 
 		 747 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.21 
 
 		 712 aa  308  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.71 
 
 		 741 aa  297  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  44.99 
 
 		 685 aa  279  9e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.54 
 
 		 693 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  46.43 
 
 		 681 aa  278  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.53 
 
 		 684 aa  263  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  42.01 
 
 		 1478 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  43.33 
 
 		 1478 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  41.82 
 
 		 1478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  43.03 
 
 		 1478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  41.82 
 
 		 1478 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.09 
 
 		 1505 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.12 
 
 		 1478 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  41.82 
 
 		 1478 aa  233  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  41.82 
 
 		 1478 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  41.82 
 
 		 1478 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  41.82 
 
 		 1478 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  40.84 
 
 		 1477 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  41.46 
 
 		 1487 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 1482 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  41.16 
 
 		 1487 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40 
 
 		 1524 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  41.72 
 
 		 1486 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.77 
 
 		 1519 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  42.39 
 
 		 1482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 1482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 1487 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.62 
 
 		 1510 aa  223  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  40.06 
 
 		 1486 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  40.06 
 
 		 1486 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.28 
 
 		 1518 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 1535 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 1485 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 1485 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  39.88 
 
 		 1510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.18 
 
 		 1577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 1482 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  40.73 
 
 		 1564 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  42.39 
 
 		 1482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 1486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 		 1572 aa  220  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 1482 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.38 
 
 		 1499 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.38 
 
 		 1499 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 		 1572 aa  220  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  40.43 
 
 		 1563 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 1486 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 1482 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 1482 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 1482 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.05 
 
 		 1510 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  39.43 
 
 		 1580 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 1483 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  39.53 
 
 		 1512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  41.67 
 
 		 1507 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 1462 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.17 
 
 		 1502 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 1462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 1482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.41 
 
 		 1509 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  40.37 
 
 		 1498 aa  216  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 1482 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 1486 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 1460 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.77 
 
 		 1534 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 1482 aa  216  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  36.5 
 
 		 1533 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  39.46 
 
 		 1574 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1571 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>