More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_946 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  99.2 
 
 		 500 aa  1023    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 		 500 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  65.26 
 
 		 501 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  64.41 
 
 		 507 aa  669    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.31 
 
 		 507 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  62.96 
 
 		 507 aa  665    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  66.67 
 
 		 502 aa  700    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  67.4 
 
 		 502 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  64.41 
 
 		 507 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  61.65 
 
 		 501 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  62.48 
 
 		 497 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  100 
 
 		 500 aa  1030    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  63.36 
 
 		 507 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  96.8 
 
 		 500 aa  1004    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  60.32 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  61.32 
 
 		 509 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  60.52 
 
 		 509 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  58.41 
 
 		 530 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.34 
 
 		 510 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  55.69 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  56.53 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  55.88 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.51 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  54.91 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  54.82 
 
 		 503 aa  568  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  55.11 
 
 		 503 aa  570  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  55.36 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  55.31 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  50.7 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  51.67 
 
 		 747 aa  310  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.26 
 
 		 712 aa  307  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  45.21 
 
 		 741 aa  276  9e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  38.56 
 
 		 685 aa  256  5e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.2 
 
 		 693 aa  256  7e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  38.56 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.92 
 
 		 1519 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  43.35 
 
 		 684 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.79 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.49 
 
 		 1510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  39.18 
 
 		 1487 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 1487 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  40.68 
 
 		 1507 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.39 
 
 		 496 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  40.54 
 
 		 1507 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  40.25 
 
 		 1510 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  40.79 
 
 		 1546 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 1487 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  40.5 
 
 		 1510 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  39 
 
 		 1554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 1482 aa  220  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 1486 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 1477 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.28 
 
 		 1509 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  35.62 
 
 		 1512 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  40.25 
 
 		 1513 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.37 
 
 		 1524 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 1488 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 1482 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  40.06 
 
 		 1460 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 1482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  38.65 
 
 		 1516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 1482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.88 
 
 		 1577 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1462 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 1482 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  35.36 
 
 		 1512 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.82 
 
 		 1533 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  35.36 
 
 		 1512 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 1489 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.66 
 
 		 1486 aa  216  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.01 
 
 		 1468 aa  216  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.28 
 
 		 1505 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 1484 aa  216  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  39.26 
 
 		 1499 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 1482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  39.26 
 
 		 1499 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 1486 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.51 
 
 		 1483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.48 
 
 		 1469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 1481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.73 
 
 		 1510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.31 
 
 		 1510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  37.89 
 
 		 1478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 1482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  37.13 
 
 		 1512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  38.97 
 
 		 1583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.87 
 
 		 1567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  39.87 
 
 		 1483 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  39.27 
 
 		 1563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 1486 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.79 
 
 		 1574 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1572 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>