More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1301 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  64.36 
 
 
505 aa  680    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  68.12 
 
 
502 aa  705    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  70.14 
 
 
503 aa  748    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 
510 aa  1050    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  83.92 
 
 
510 aa  885    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  69.94 
 
 
503 aa  736    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  83.53 
 
 
510 aa  902    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  69.17 
 
 
502 aa  729    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  81.57 
 
 
510 aa  845    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  84.12 
 
 
510 aa  884    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  69.11 
 
 
503 aa  726    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  60.2 
 
 
507 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  59.3 
 
 
500 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.66 
 
 
502 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  60.76 
 
 
502 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  58.48 
 
 
507 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.94 
 
 
501 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.15 
 
 
507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  58.51 
 
 
507 aa  601  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  58.51 
 
 
507 aa  601  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  56.29 
 
 
530 aa  599  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  55.69 
 
 
500 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.27 
 
 
500 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  55.29 
 
 
500 aa  590  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  57.66 
 
 
497 aa  586  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  59.69 
 
 
501 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  56.28 
 
 
509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  57.29 
 
 
509 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.2 
 
 
509 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  44.57 
 
 
747 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.01 
 
 
712 aa  311  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  46.42 
 
 
741 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  47.02 
 
 
681 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  44.99 
 
 
685 aa  282  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.54 
 
 
693 aa  280  6e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  42.19 
 
 
684 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.73 
 
 
1487 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  43.23 
 
 
1482 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  42.58 
 
 
1482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  42.49 
 
 
1482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  42.42 
 
 
1478 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  41.64 
 
 
1512 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.83 
 
 
1505 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  39.19 
 
 
1487 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  42.42 
 
 
1478 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.38 
 
 
1510 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.53 
 
 
1502 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  40.73 
 
 
1564 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  41.1 
 
 
1482 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  40.8 
 
 
1482 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  42.12 
 
 
1478 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  42.17 
 
 
1487 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.18 
 
 
1577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  40.43 
 
 
1563 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.82 
 
 
1524 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.44 
 
 
496 aa  217  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  42.9 
 
 
1482 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  40.49 
 
 
1486 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  40.49 
 
 
1486 aa  217  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  40.36 
 
 
1478 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  39.02 
 
 
1486 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 
1572 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.43 
 
 
1511 aa  216  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 
1572 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.12 
 
 
1486 aa  216  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  40.96 
 
 
1478 aa  216  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  40.62 
 
 
1482 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  40.62 
 
 
1482 aa  216  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  40.66 
 
 
1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  40.62 
 
 
1482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  40.66 
 
 
1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  40.66 
 
 
1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  40.66 
 
 
1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  40.54 
 
 
1477 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  40.36 
 
 
1478 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.67 
 
 
1510 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  40.62 
 
 
1482 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.84 
 
 
1510 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.37 
 
 
1554 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.32 
 
 
529 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  41.61 
 
 
1462 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.76 
 
 
1525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.79 
 
 
1509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.89 
 
 
1512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.67 
 
 
1550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  41.61 
 
 
1482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  41.61 
 
 
1462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  41.61 
 
 
1482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  37.67 
 
 
1518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  41.61 
 
 
1482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  39.88 
 
 
1486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 
1519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  40.32 
 
 
529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  39.12 
 
 
1499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  39.12 
 
 
1499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  40.51 
 
 
1460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  40.78 
 
 
1483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  39.43 
 
 
1580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  42.26 
 
 
1481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.69 
 
 
1512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>