More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0092 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 
496 aa  1022    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.98 
 
 
492 aa  594  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.22 
 
 
529 aa  591  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  57.14 
 
 
529 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  57.81 
 
 
529 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.86 
 
 
502 aa  336  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.4 
 
 
514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  42.39 
 
 
515 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.8 
 
 
516 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.3 
 
 
510 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.15 
 
 
516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.75 
 
 
545 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.05 
 
 
516 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.98 
 
 
535 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  40.61 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  42.08 
 
 
518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.41 
 
 
546 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.32 
 
 
440 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.83 
 
 
547 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  34.48 
 
 
502 aa  226  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  35.39 
 
 
500 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  35.63 
 
 
500 aa  223  7e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.56 
 
 
500 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  39.4 
 
 
507 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  39.4 
 
 
507 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  36.1 
 
 
497 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  40 
 
 
510 aa  216  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.01 
 
 
458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.11 
 
 
502 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.02 
 
 
441 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.21 
 
 
456 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.48 
 
 
500 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.97 
 
 
503 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  38.2 
 
 
510 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.2 
 
 
507 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  32.51 
 
 
505 aa  206  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.06 
 
 
510 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  37.86 
 
 
502 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  38.06 
 
 
510 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.86 
 
 
446 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.36 
 
 
507 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.86 
 
 
446 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.86 
 
 
446 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.24 
 
 
447 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  31.2 
 
 
501 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  39.1 
 
 
530 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  36.54 
 
 
503 aa  203  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.93 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.99 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.41 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  29.69 
 
 
509 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  34.69 
 
 
442 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.69 
 
 
442 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.59 
 
 
444 aa  200  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.13 
 
 
501 aa  200  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.8 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  36.36 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.62 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.84 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.77 
 
 
441 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  36.21 
 
 
502 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.44 
 
 
454 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.13 
 
 
509 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.69 
 
 
442 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.43 
 
 
509 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.54 
 
 
441 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.55 
 
 
437 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.24 
 
 
507 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.32 
 
 
472 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.59 
 
 
444 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  36.16 
 
 
446 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.16 
 
 
446 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  34.24 
 
 
444 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.51 
 
 
448 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.59 
 
 
447 aa  193  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.59 
 
 
447 aa  193  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.39 
 
 
445 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.94 
 
 
466 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.29 
 
 
446 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.45 
 
 
442 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  35 
 
 
441 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.81 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  37.5 
 
 
510 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  31.08 
 
 
741 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.65 
 
 
453 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.86 
 
 
497 aa  170  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.85 
 
 
531 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.48 
 
 
693 aa  167  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.61 
 
 
497 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  36.71 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  31.94 
 
 
685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.67 
 
 
496 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.67 
 
 
496 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.67 
 
 
496 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.67 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.97 
 
 
712 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.76 
 
 
527 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  30.83 
 
 
747 aa  161  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  33.23 
 
 
522 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.74 
 
 
496 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>