More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2957 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  61.79 
 
 
515 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.2 
 
 
516 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
510 aa  1050    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.72 
 
 
516 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.18 
 
 
514 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.26 
 
 
516 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.29 
 
 
502 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  62.91 
 
 
518 aa  653    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  62.63 
 
 
466 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.36 
 
 
535 aa  545  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.69 
 
 
547 aa  501  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.24 
 
 
546 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.83 
 
 
545 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.55 
 
 
440 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.9 
 
 
529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  41.42 
 
 
529 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  48.12 
 
 
529 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  43.3 
 
 
496 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.84 
 
 
492 aa  316  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.45 
 
 
472 aa  211  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  37.39 
 
 
502 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.38 
 
 
507 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  39.25 
 
 
505 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  35.45 
 
 
510 aa  199  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.9 
 
 
503 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  36.02 
 
 
510 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.73 
 
 
507 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.91 
 
 
501 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  35.5 
 
 
502 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  35.45 
 
 
510 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  40.07 
 
 
497 aa  193  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.45 
 
 
510 aa  193  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  34.05 
 
 
502 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.4 
 
 
503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  37.25 
 
 
507 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  37.25 
 
 
507 aa  191  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.18 
 
 
441 aa  190  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  39.13 
 
 
530 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  34.71 
 
 
500 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.96 
 
 
530 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  31.3 
 
 
507 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  35.96 
 
 
503 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.79 
 
 
500 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  34.35 
 
 
500 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  37.5 
 
 
509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  34.04 
 
 
500 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  36.43 
 
 
741 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.1 
 
 
437 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.32 
 
 
502 aa  183  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  35.65 
 
 
501 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.65 
 
 
441 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.67 
 
 
458 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.94 
 
 
455 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  33.64 
 
 
442 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.59 
 
 
526 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
526 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
526 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
586 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
557 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
526 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  33.52 
 
 
546 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.82 
 
 
509 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  33.52 
 
 
546 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  33.03 
 
 
446 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.03 
 
 
446 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.04 
 
 
547 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  35.75 
 
 
496 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  37.18 
 
 
509 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  33.24 
 
 
557 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.79 
 
 
507 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  36.07 
 
 
510 aa  177  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.83 
 
 
536 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.27 
 
 
448 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  33.82 
 
 
529 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  34.8 
 
 
535 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.74 
 
 
496 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.1 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.69 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 
447 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.13 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  33.53 
 
 
536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.36 
 
 
456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.62 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  33.82 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  33.72 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.88 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.82 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.26 
 
 
527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  35.02 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  33.53 
 
 
539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.92 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  33.43 
 
 
670 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.61 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.42 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  36.31 
 
 
546 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  32.93 
 
 
537 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  36.31 
 
 
536 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.44 
 
 
442 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  34.35 
 
 
556 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  32.39 
 
 
539 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>