More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6006 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.02 
 
 		 448 aa  710    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.7 
 
 		 447 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  77.05 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  83.87 
 
 		 444 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  78.65 
 
 		 446 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.85 
 
 		 446 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  83.6 
 
 		 441 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  95.93 
 
 		 442 aa  812    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.28 
 
 		 441 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  87.3 
 
 		 445 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.62 
 
 		 447 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  96.38 
 
 		 442 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.21 
 
 		 441 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  82 
 
 		 441 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  79.09 
 
 		 440 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  85.58 
 
 		 444 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.65 
 
 		 446 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  77.05 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.47 
 
 		 447 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.91 
 
 		 458 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  95.25 
 
 		 442 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  96.15 
 
 		 442 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.45 
 
 		 444 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.16 
 
 		 442 aa  708    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 442 aa  903    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  77.05 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.96 
 
 		 447 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.08 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.47 
 
 		 455 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  67.28 
 
 		 460 aa  531  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.82 
 
 		 456 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.65 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  37.62 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.62 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.52 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.32 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  35.77 
 
 		 529 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  34.94 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.67 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  38.33 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.95 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  35.1 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.57 
 
 		 535 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  38.02 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.73 
 
 		 530 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.6 
 
 		 502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  35.38 
 
 		 505 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  35.14 
 
 		 502 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.78 
 
 		 510 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.78 
 
 		 510 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  34.71 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.69 
 
 		 510 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.81 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  32.7 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.64 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  33.74 
 
 		 502 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.73 
 
 		 501 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.94 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  33.1 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  36.76 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  36.76 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.55 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.91 
 
 		 516 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  32.33 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.62 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.63 
 
 		 514 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.1 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.74 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.01 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.15 
 
 		 500 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.33 
 
 		 466 aa  192  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.18 
 
 		 500 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32.07 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  32.95 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.68 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.59 
 
 		 509 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 509 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.08 
 
 		 547 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  33.01 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.05 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.94 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.78 
 
 		 472 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 747 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.35 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.7 
 
 		 741 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.05 
 
 		 712 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.15 
 
 		 507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  30.85 
 
 		 539 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.48 
 
 		 581 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.88 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.76 
 
 		 693 aa  142  8e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  28.78 
 
 		 600 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  36.29 
 
 		 685 aa  140  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.27 
 
 		 526 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.22 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.21 
 
 		 1510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  30.28 
 
 		 511 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  29.4 
 
 		 670 aa  136  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  32.52 
 
 		 681 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>