More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2461 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  75.94 
 
 		 529 aa  840    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 529 aa  1090    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  77.13 
 
 		 529 aa  862    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.14 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.65 
 
 		 492 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.34 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.14 
 
 		 535 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.17 
 
 		 502 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  44.37 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.42 
 
 		 510 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  45.69 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  47.16 
 
 		 515 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.95 
 
 		 545 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.85 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.66 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.64 
 
 		 514 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.08 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.08 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.71 
 
 		 440 aa  316  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  33.69 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.36 
 
 		 458 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  34.09 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.26 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.26 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.26 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.32 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.41 
 
 		 502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.22 
 
 		 503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.88 
 
 		 445 aa  217  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.27 
 
 		 447 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  36.39 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  36.39 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.59 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.34 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  40.32 
 
 		 510 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.1 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  32.91 
 
 		 500 aa  213  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  34.32 
 
 		 505 aa  213  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.18 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.77 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.38 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.31 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  34.87 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  34.87 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  36.31 
 
 		 510 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.62 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.03 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  39.03 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.7 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.73 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.14 
 
 		 530 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.43 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.81 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  37.38 
 
 		 442 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.91 
 
 		 447 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.19 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.91 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.91 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.68 
 
 		 502 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  31.99 
 
 		 503 aa  206  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.59 
 
 		 500 aa  206  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  37.99 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.15 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.16 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.38 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.19 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.8 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  37.81 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.56 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.81 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  38.01 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.56 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  37.5 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  34.82 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  31.9 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.66 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.05 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.33 
 
 		 509 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  36.51 
 
 		 553 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.24 
 
 		 507 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.95 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.82 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  38.17 
 
 		 510 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  35.9 
 
 		 555 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  36.64 
 
 		 556 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  36.19 
 
 		 555 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.07 
 
 		 509 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.75 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.73 
 
 		 495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.37 
 
 		 496 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.36 
 
 		 534 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.37 
 
 		 496 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.37 
 
 		 496 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  38.07 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  32.43 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.36 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.62 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.68 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.62 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.62 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>