More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1940 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.59 
 
 		 454 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  82.6 
 
 		 458 aa  674    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  79.68 
 
 		 446 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.78 
 
 		 446 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  84.58 
 
 		 442 aa  722    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  98.21 
 
 		 448 aa  884    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.71 
 
 		 442 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.13 
 
 		 442 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.59 
 
 		 441 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  81.59 
 
 		 440 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.6 
 
 		 446 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  79.32 
 
 		 446 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.93 
 
 		 441 aa  717    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  87.99 
 
 		 441 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.84 
 
 		 445 aa  714    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  86.53 
 
 		 444 aa  731    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.7 
 
 		 442 aa  713    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 447 aa  901    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  94.97 
 
 		 442 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  79.32 
 
 		 446 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  82.33 
 
 		 441 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.77 
 
 		 442 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.09 
 
 		 447 aa  648    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.88 
 
 		 444 aa  726    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.09 
 
 		 447 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  99.55 
 
 		 447 aa  899    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  79.32 
 
 		 446 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  81.05 
 
 		 444 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.86 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.05 
 
 		 455 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.23 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.89 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  37.91 
 
 		 529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.08 
 
 		 492 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.02 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.59 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.42 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.41 
 
 		 529 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  35.13 
 
 		 510 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  35.24 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.66 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.66 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.8 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.13 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  35.14 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.16 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  35.48 
 
 		 529 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  37.04 
 
 		 502 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 		 535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  39.02 
 
 		 502 aa  216  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  34.52 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  36.32 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  34.84 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  35.49 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  35.49 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.81 
 
 		 501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.58 
 
 		 502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  32.74 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  33.72 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.85 
 
 		 516 aa  206  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  35.32 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  33.76 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.88 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.59 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.59 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.29 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.23 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.87 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  33.49 
 
 		 500 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.79 
 
 		 466 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  35.67 
 
 		 509 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.79 
 
 		 510 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  35.05 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.27 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.82 
 
 		 546 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.67 
 
 		 509 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.02 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  35.26 
 
 		 747 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.9 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.35 
 
 		 741 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.33 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.94 
 
 		 712 aa  163  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.97 
 
 		 693 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.1 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.24 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  30.61 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  34.05 
 
 		 685 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.87 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.79 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  34.05 
 
 		 681 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.15 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  31.86 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.32 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  33.54 
 
 		 684 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  30.1 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.59 
 
 		 1510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>