More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1322 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 453 aa  921    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  45.63 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.82 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.69 
 
 		 466 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.59 
 
 		 529 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  31.52 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.91 
 
 		 496 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  29.87 
 
 		 529 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  33.25 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.16 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.41 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.57 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 516 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.15 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.08 
 
 		 514 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.01 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.56 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.16 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  34.04 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  34.04 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.09 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  30.1 
 
 		 515 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  32.33 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  31.85 
 
 		 510 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.85 
 
 		 510 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.06 
 
 		 502 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  32.04 
 
 		 502 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.03 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.55 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  31.21 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.85 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.96 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.64 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.75 
 
 		 507 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.18 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.31 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.48 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.46 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.67 
 
 		 500 aa  146  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  29.2 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.8 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.93 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.72 
 
 		 440 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.96 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.5 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.29 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.78 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  32.33 
 
 		 503 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  31.44 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.36 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.75 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.3 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  33.69 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.3 
 
 		 502 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.48 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.39 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  32.17 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  29.85 
 
 		 509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.06 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.05 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.06 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  31.72 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.31 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.06 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  31.26 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.98 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.98 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.98 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.18 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.49 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  29.67 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.21 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.16 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.11 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.1 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.72 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  28.9 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.37 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.14 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  28.25 
 
 		 685 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.56 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.56 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.06 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.06 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.06 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  29.87 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.85 
 
 		 712 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  28.49 
 
 		 747 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3656  hypothetical protein  28.14 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  30.56 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  27.89 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3332  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.14 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.81 
 
 		 693 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3436  hypothetical protein  27.87 
 
 		 522 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3706  hypothetical protein  27.87 
 
 		 522 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>