More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2041 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  100 
 
 		 525 aa  1081    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.29 
 
 		 525 aa  877    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.29 
 
 		 525 aa  877    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1562  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.46 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3679  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.64 
 
 		 524 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3754  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.25 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3674  hypothetical protein  48.53 
 
 		 522 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3332  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.58 
 
 		 522 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3436  hypothetical protein  47.43 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3348  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.43 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3706  hypothetical protein  47.43 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3656  hypothetical protein  47.43 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3397  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.43 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.73 
 
 		 520 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.09 
 
 		 530 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.74 
 
 		 496 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.7 
 
 		 496 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.9 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.33 
 
 		 581 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.7 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.7 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.55 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.16 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.62 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  38.31 
 
 		 519 aa  336  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.38 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.22 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  37.52 
 
 		 543 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.53 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  37.45 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.35 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  37.98 
 
 		 564 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  36.52 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.29 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  37.01 
 
 		 523 aa  326  7e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  36.81 
 
 		 523 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  37.77 
 
 		 600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  36.93 
 
 		 533 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.1 
 
 		 543 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.92 
 
 		 527 aa  316  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.22 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  38.88 
 
 		 522 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.17 
 
 		 504 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3003  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.31 
 
 		 506 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  36.85 
 
 		 539 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  36.85 
 
 		 539 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  38.01 
 
 		 539 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  36.45 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.29 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  35.66 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.11 
 
 		 577 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  37.8 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  36.25 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  35.78 
 
 		 537 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  35.43 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  35.43 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  35.43 
 
 		 526 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  35.81 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  35.81 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  37.58 
 
 		 557 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.47 
 
 		 469 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  35.81 
 
 		 532 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  35.93 
 
 		 586 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  36.06 
 
 		 539 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.29 
 
 		 543 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  36.74 
 
 		 539 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  35.93 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  36.45 
 
 		 539 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  35.93 
 
 		 546 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.66 
 
 		 543 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  35.81 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  37.03 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  36.06 
 
 		 539 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  35.93 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  37.2 
 
 		 539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.85 
 
 		 547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.56 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  37.79 
 
 		 539 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  35.62 
 
 		 553 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.66 
 
 		 542 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.59 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.85 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.4 
 
 		 531 aa  306  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  36.42 
 
 		 554 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.04 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.77 
 
 		 547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  37.09 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.27 
 
 		 536 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.34 
 
 		 541 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.81 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  35.33 
 
 		 536 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  34.69 
 
 		 535 aa  303  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.17 
 
 		 547 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.98 
 
 		 532 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.22 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.86 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  35.42 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.48 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.79 
 
 		 534 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.79 
 
 		 534 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>