More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0262 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  60.75 
 
 		 546 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  60.53 
 
 		 555 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  59.32 
 
 		 539 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  62.22 
 
 		 537 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  63.71 
 
 		 532 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.75 
 
 		 572 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  58.21 
 
 		 539 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  59.25 
 
 		 540 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  59.4 
 
 		 537 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.62 
 
 		 532 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  62.27 
 
 		 526 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  62.27 
 
 		 557 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  59.7 
 
 		 539 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.95 
 
 		 539 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  59.74 
 
 		 539 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  59.55 
 
 		 539 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  59.32 
 
 		 539 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  62.27 
 
 		 526 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.48 
 
 		 543 aa  977    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  60.15 
 
 		 555 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.16 
 
 		 540 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  62.88 
 
 		 557 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  92.45 
 
 		 543 aa  1031    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  62.27 
 
 		 586 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  59.93 
 
 		 539 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.22 
 
 		 541 aa  878    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  59.18 
 
 		 536 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  60.49 
 
 		 536 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 543 aa  1123    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  61.21 
 
 		 532 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.46 
 
 		 547 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.74 
 
 		 541 aa  926    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  62.27 
 
 		 526 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.9 
 
 		 541 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.18 
 
 		 536 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  59.74 
 
 		 539 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  59.77 
 
 		 553 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.25 
 
 		 532 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.14 
 
 		 572 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  59.74 
 
 		 539 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  61.82 
 
 		 536 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  59.93 
 
 		 539 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  63.21 
 
 		 539 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  63.75 
 
 		 554 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  60.34 
 
 		 556 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.1 
 
 		 547 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  82.81 
 
 		 541 aa  915    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  62.27 
 
 		 546 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  62.27 
 
 		 546 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  60.28 
 
 		 535 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  55.58 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.45 
 
 		 577 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.86 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.49 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.25 
 
 		 581 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  55.07 
 
 		 600 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.96 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  52.62 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  53.22 
 
 		 564 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.17 
 
 		 527 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.37 
 
 		 526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.36 
 
 		 551 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  54.94 
 
 		 526 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  54 
 
 		 548 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.56 
 
 		 543 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  49.81 
 
 		 550 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  50 
 
 		 543 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  55.16 
 
 		 519 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.99 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.38 
 
 		 550 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.25 
 
 		 529 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.1 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.69 
 
 		 547 aa  545  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  48.56 
 
 		 523 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  48.37 
 
 		 523 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.77 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  49.9 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.42 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.09 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.72 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  51.55 
 
 		 670 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  40.45 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.43 
 
 		 530 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.04 
 
 		 520 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.67 
 
 		 493 aa  350  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  40.62 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.53 
 
 		 534 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.53 
 
 		 534 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.53 
 
 		 534 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.83 
 
 		 497 aa  339  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.37 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.06 
 
 		 500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.79 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.02 
 
 		 533 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.56 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.48 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.02 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>