More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2363 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  61.93 
 
 
535 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.13 
 
 
572 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  65.5 
 
 
555 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  66.93 
 
 
539 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  76.22 
 
 
532 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  64.21 
 
 
540 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.55 
 
 
543 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  83.5 
 
 
537 aa  892    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.95 
 
 
532 aa  803    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1082    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  64.77 
 
 
553 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  99.43 
 
 
546 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  99.62 
 
 
557 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.34 
 
 
539 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  63.62 
 
 
546 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  89.08 
 
 
539 aa  962    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.52 
 
 
577 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  66.93 
 
 
536 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  64.13 
 
 
532 aa  684    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.75 
 
 
541 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.82 
 
 
540 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  67.13 
 
 
539 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.16 
 
 
536 aa  897    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  89.47 
 
 
539 aa  964    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.5 
 
 
551 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  97.69 
 
 
557 aa  1050    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  66.8 
 
 
546 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.47 
 
 
543 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  64.93 
 
 
556 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  64.91 
 
 
555 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.12 
 
 
541 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  69.37 
 
 
554 aa  721    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  83.96 
 
 
536 aa  896    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1082    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.27 
 
 
543 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1082    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.81 
 
 
547 aa  666    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.47 
 
 
541 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  61.03 
 
 
600 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  66.93 
 
 
539 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.99 
 
 
572 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  90.25 
 
 
539 aa  972    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  67.35 
 
 
537 aa  666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  89.47 
 
 
539 aa  965    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  66.8 
 
 
536 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  66.73 
 
 
539 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  90.45 
 
 
539 aa  973    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  90.45 
 
 
539 aa  972    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.69 
 
 
581 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  99.62 
 
 
546 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  90.45 
 
 
539 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  73.96 
 
 
532 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.22 
 
 
547 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  99.81 
 
 
586 aa  1082    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  62.03 
 
 
541 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.49 
 
 
553 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.51 
 
 
541 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  54.85 
 
 
533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.87 
 
 
526 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.56 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.71 
 
 
527 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.72 
 
 
551 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  58.42 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  55.51 
 
 
550 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.3 
 
 
550 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  53.97 
 
 
523 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  54.38 
 
 
548 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  53.09 
 
 
564 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  53.77 
 
 
523 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.16 
 
 
547 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.51 
 
 
529 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.58 
 
 
557 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  53.44 
 
 
670 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  51.82 
 
 
519 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.48 
 
 
529 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.05 
 
 
543 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.1 
 
 
504 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  53.64 
 
 
543 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  51.83 
 
 
555 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.22 
 
 
550 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.07 
 
 
499 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.99 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.08 
 
 
500 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.04 
 
 
531 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.82 
 
 
530 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.55 
 
 
507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  41.85 
 
 
529 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.87 
 
 
496 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.65 
 
 
496 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.65 
 
 
496 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.65 
 
 
496 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  41.09 
 
 
511 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.89 
 
 
520 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.2 
 
 
497 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  41.61 
 
 
496 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.49 
 
 
525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.49 
 
 
525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.49 
 
 
525 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.74 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.74 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>