More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0806 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  99.4 
 
 
496 aa  1028    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  89.72 
 
 
496 aa  942    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
496 aa  1032    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.53 
 
 
496 aa  959    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  99.6 
 
 
496 aa  1030    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.58 
 
 
530 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.32 
 
 
520 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  99.6 
 
 
496 aa  1030    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  92.14 
 
 
496 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  92.34 
 
 
496 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.7 
 
 
495 aa  785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.53 
 
 
496 aa  962    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  61.26 
 
 
511 aa  615  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.09 
 
 
507 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.96 
 
 
497 aa  598  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3003  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.71 
 
 
506 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.05 
 
 
497 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.77 
 
 
493 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  42.59 
 
 
523 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.7 
 
 
581 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.92 
 
 
531 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  42.18 
 
 
523 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  41.53 
 
 
600 aa  364  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  38.14 
 
 
529 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.07 
 
 
534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  40.08 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  41.43 
 
 
553 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.76 
 
 
504 aa  352  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  40.94 
 
 
532 aa  349  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  41.03 
 
 
539 aa  349  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  41.87 
 
 
526 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.98 
 
 
525 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  41.87 
 
 
526 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.98 
 
 
525 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  41.87 
 
 
526 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.98 
 
 
525 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  41.87 
 
 
586 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  41.87 
 
 
557 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  42.06 
 
 
539 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  41.87 
 
 
546 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  42.16 
 
 
557 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.44 
 
 
547 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.51 
 
 
534 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.58 
 
 
524 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.51 
 
 
534 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.51 
 
 
534 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  42.04 
 
 
539 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  41.45 
 
 
539 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  41.87 
 
 
546 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  42.04 
 
 
539 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.87 
 
 
550 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  41.24 
 
 
539 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.57 
 
 
540 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.2 
 
 
577 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  41.06 
 
 
555 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  42.04 
 
 
539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  41.21 
 
 
546 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  41.43 
 
 
539 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  41.41 
 
 
543 aa  342  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  41.06 
 
 
555 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.76 
 
 
557 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  38.78 
 
 
535 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  37.9 
 
 
525 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  40.85 
 
 
536 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  41.18 
 
 
536 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.51 
 
 
547 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  41 
 
 
536 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  40.56 
 
 
555 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  42.26 
 
 
539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  41.06 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  40.57 
 
 
538 aa  340  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  41.95 
 
 
537 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  40.5 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.21 
 
 
536 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.11 
 
 
499 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.57 
 
 
533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.88 
 
 
553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.29 
 
 
539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  40.64 
 
 
539 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.05 
 
 
469 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  41.63 
 
 
537 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  40.88 
 
 
546 aa  333  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.31 
 
 
525 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.31 
 
 
525 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.03 
 
 
572 aa  332  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.78 
 
 
551 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  39.08 
 
 
533 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.65 
 
 
539 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.08 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.79 
 
 
532 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.61 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.34 
 
 
527 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  37.6 
 
 
522 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.02 
 
 
543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.83 
 
 
532 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.71 
 
 
547 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  40.47 
 
 
564 aa  326  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.17 
 
 
551 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.22 
 
 
543 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  36.8 
 
 
550 aa  322  8e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>