More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0478 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  66.67 
 
 		 539 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.92 
 
 		 572 aa  888    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  60.14 
 
 		 555 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  62.39 
 
 		 539 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  64.97 
 
 		 532 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.16 
 
 		 532 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  66.99 
 
 		 546 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  66.99 
 
 		 546 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  60.4 
 
 		 540 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  62.57 
 
 		 539 aa  712    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.5 
 
 		 536 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  66.99 
 
 		 526 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.24 
 
 		 543 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  66.99 
 
 		 526 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  66.99 
 
 		 557 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.55 
 
 		 539 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  65.51 
 
 		 539 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.61 
 
 		 532 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.76 
 
 		 540 aa  679    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  60.47 
 
 		 553 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  62.39 
 
 		 539 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  65.32 
 
 		 539 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  67.37 
 
 		 557 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  66 
 
 		 546 aa  745    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.5 
 
 		 543 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  60.29 
 
 		 555 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.99 
 
 		 541 aa  705    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  66.99 
 
 		 586 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  64.31 
 
 		 536 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.68 
 
 		 581 aa  641    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  62.66 
 
 		 546 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.14 
 
 		 543 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.89 
 
 		 547 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.09 
 
 		 541 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 572 aa  1177    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  65.13 
 
 		 539 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.98 
 
 		 551 aa  748    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  66.99 
 
 		 526 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.32 
 
 		 547 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  70.5 
 
 		 554 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.18 
 
 		 553 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.57 
 
 		 541 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  58.47 
 
 		 537 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  65.32 
 
 		 539 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  62.11 
 
 		 536 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  62.39 
 
 		 539 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  60.87 
 
 		 532 aa  678    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  65.32 
 
 		 539 aa  727    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  63.88 
 
 		 537 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  60.65 
 
 		 556 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  65.51 
 
 		 539 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  61.38 
 
 		 536 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  57.19 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  57.45 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.23 
 
 		 541 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.14 
 
 		 577 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  57.32 
 
 		 541 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.41 
 
 		 527 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.01 
 
 		 526 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  55.12 
 
 		 564 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.26 
 
 		 551 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  50 
 
 		 550 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  52.12 
 
 		 519 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  53.17 
 
 		 526 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  50.65 
 
 		 533 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.82 
 
 		 550 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.65 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.73 
 
 		 529 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.58 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.54 
 
 		 529 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  49.08 
 
 		 543 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.19 
 
 		 557 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  49.21 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  49.01 
 
 		 523 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  49.72 
 
 		 548 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  51.77 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.12 
 
 		 550 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.06 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  48.13 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.8 
 
 		 499 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.54 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.14 
 
 		 500 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.27 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.07 
 
 		 525 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.07 
 
 		 525 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.07 
 
 		 525 aa  353  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.75 
 
 		 530 aa  350  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  39.71 
 
 		 529 aa  346  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.98 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.49 
 
 		 524 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  42.49 
 
 		 522 aa  343  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.72 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.72 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.72 
 
 		 534 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.48 
 
 		 533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  41 
 
 		 539 aa  336  9e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.04 
 
 		 497 aa  332  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.03 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.03 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>