More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1539 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  85.74 
 
 
539 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.19 
 
 
577 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  77.63 
 
 
555 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  85.55 
 
 
539 aa  960    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.42 
 
 
541 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  67.34 
 
 
539 aa  709    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  64.85 
 
 
532 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  66.8 
 
 
586 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  77.82 
 
 
555 aa  872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  78.01 
 
 
556 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.1 
 
 
532 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.74 
 
 
536 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  62.07 
 
 
540 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  66.8 
 
 
526 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  71.59 
 
 
540 aa  796    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  85.18 
 
 
539 aa  963    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  67 
 
 
557 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 
539 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.18 
 
 
539 aa  962    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  66.34 
 
 
539 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  84.86 
 
 
536 aa  949    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  66.8 
 
 
526 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.67 
 
 
543 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 
539 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.67 
 
 
572 aa  670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.35 
 
 
532 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  67.39 
 
 
557 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  85.55 
 
 
539 aa  961    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.13 
 
 
543 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  67 
 
 
546 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.15 
 
 
551 aa  668    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.01 
 
 
541 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  64.74 
 
 
536 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  61.39 
 
 
535 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.75 
 
 
543 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  71.37 
 
 
532 aa  813    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.11 
 
 
547 aa  764    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.12 
 
 
541 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  63.21 
 
 
554 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  61.8 
 
 
600 aa  669    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.48 
 
 
572 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 
539 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1125    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.34 
 
 
553 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  76.82 
 
 
537 aa  817    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 
539 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  99.25 
 
 
536 aa  1098    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  66.53 
 
 
539 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  78.01 
 
 
553 aa  879    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.6 
 
 
581 aa  676    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  65.81 
 
 
537 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  67 
 
 
546 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  66.8 
 
 
526 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  59.59 
 
 
541 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  62.32 
 
 
546 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.32 
 
 
547 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.82 
 
 
541 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.42 
 
 
527 aa  589  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.05 
 
 
526 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  58.2 
 
 
526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  53.3 
 
 
533 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  52.47 
 
 
550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.09 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  51.72 
 
 
523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  53.39 
 
 
543 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  51.34 
 
 
523 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.44 
 
 
551 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  53.75 
 
 
564 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.56 
 
 
543 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.27 
 
 
529 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.81 
 
 
542 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  53.61 
 
 
670 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.21 
 
 
529 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.19 
 
 
550 aa  535  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  50.3 
 
 
519 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  52.85 
 
 
548 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.97 
 
 
547 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.41 
 
 
557 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.32 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.25 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  52.57 
 
 
555 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.69 
 
 
469 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.12 
 
 
531 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  42.67 
 
 
511 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.75 
 
 
530 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.26 
 
 
497 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.56 
 
 
507 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  39.6 
 
 
529 aa  353  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.12 
 
 
493 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.91 
 
 
520 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  42.02 
 
 
538 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.27 
 
 
525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.27 
 
 
525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.27 
 
 
525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.64 
 
 
534 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.64 
 
 
534 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.64 
 
 
534 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.95 
 
 
534 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41 
 
 
496 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.21 
 
 
496 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>