More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3384 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.58 
 
 
577 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.04 
 
 
551 aa  755    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
542 aa  1110    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  54.74 
 
 
537 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.86 
 
 
547 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  55.16 
 
 
539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  55.56 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  55.56 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  55.36 
 
 
539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  55.95 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  55.56 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  55.56 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  55.16 
 
 
539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  55.75 
 
 
539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  55.56 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  55.16 
 
 
539 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  55.56 
 
 
546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  55.56 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  54.76 
 
 
539 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  54.76 
 
 
539 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.25 
 
 
536 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.62 
 
 
540 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  53.25 
 
 
536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  54.67 
 
 
536 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.08 
 
 
532 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  51.86 
 
 
540 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  51.98 
 
 
539 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  51.98 
 
 
539 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.23 
 
 
543 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  51.5 
 
 
535 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  51.98 
 
 
539 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  51.41 
 
 
539 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  54.27 
 
 
532 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  53.89 
 
 
532 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.07 
 
 
532 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  52.81 
 
 
536 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  53.95 
 
 
546 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.63 
 
 
541 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.39 
 
 
543 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.1 
 
 
543 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.9 
 
 
581 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  50.86 
 
 
555 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  51.37 
 
 
555 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  51.3 
 
 
600 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  51.76 
 
 
556 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.65 
 
 
572 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  50.19 
 
 
553 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.05 
 
 
539 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.4 
 
 
541 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.98 
 
 
551 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.43 
 
 
572 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  49.51 
 
 
523 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  53.46 
 
 
554 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.25 
 
 
547 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  49.51 
 
 
523 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  52.2 
 
 
546 aa  528  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.61 
 
 
543 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  54 
 
 
537 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.53 
 
 
553 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  49.34 
 
 
564 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  48.56 
 
 
533 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  51.21 
 
 
541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.96 
 
 
550 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  48.96 
 
 
550 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  52.78 
 
 
526 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.31 
 
 
527 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  47.74 
 
 
543 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.59 
 
 
541 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.71 
 
 
526 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.8 
 
 
541 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  48.13 
 
 
548 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  47.47 
 
 
519 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.05 
 
 
529 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.02 
 
 
529 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.35 
 
 
557 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.74 
 
 
547 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.25 
 
 
504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.3 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.89 
 
 
469 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  45.42 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.79 
 
 
550 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  47.33 
 
 
670 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.01 
 
 
493 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  38.6 
 
 
511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.46 
 
 
497 aa  335  9e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.08 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.87 
 
 
496 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.87 
 
 
496 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.87 
 
 
496 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.91 
 
 
520 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.52 
 
 
496 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.52 
 
 
496 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.52 
 
 
496 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.33 
 
 
531 aa  322  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  40.48 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.97 
 
 
530 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.79 
 
 
496 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  37.66 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.11 
 
 
524 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.48 
 
 
534 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>