More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1659 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.84 
 
 		 547 aa  937    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  73.67 
 
 		 555 aa  852    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.17 
 
 		 550 aa  905    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 557 aa  1160    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  72.38 
 
 		 548 aa  830    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  60.93 
 
 		 523 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  60.71 
 
 		 523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.12 
 
 		 527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  53.54 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.99 
 
 		 543 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.95 
 
 		 581 aa  548  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  53.57 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.19 
 
 		 543 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  54.25 
 
 		 539 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  54.4 
 
 		 557 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.35 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  53.58 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  53.58 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  53.58 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  53.58 
 
 		 546 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  53.58 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  53.58 
 
 		 526 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  51.61 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  51.62 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  51.61 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  53.37 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  51.61 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  52.53 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  53.37 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  52.83 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  53.37 
 
 		 539 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.41 
 
 		 539 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  53.17 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  52.63 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  51.41 
 
 		 546 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  53.17 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.03 
 
 		 536 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.19 
 
 		 540 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  51.41 
 
 		 536 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  52.33 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.4 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  50.67 
 
 		 555 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  50.87 
 
 		 555 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  50.58 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.19 
 
 		 572 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  51.63 
 
 		 536 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  53.31 
 
 		 537 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  50.6 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  55.65 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  51.21 
 
 		 532 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  52.82 
 
 		 540 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.48 
 
 		 577 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.04 
 
 		 547 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.83 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  52.15 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.28 
 
 		 551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  49.18 
 
 		 533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.41 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.46 
 
 		 541 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  49.32 
 
 		 550 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.51 
 
 		 550 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.3 
 
 		 541 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.51 
 
 		 532 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  50.71 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.7 
 
 		 572 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  54.32 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.76 
 
 		 551 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.1 
 
 		 543 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  51.77 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  52.95 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.89 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.49 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  49.79 
 
 		 526 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.47 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  48.65 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  52.13 
 
 		 519 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.97 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.17 
 
 		 541 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.35 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.57 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.45 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.45 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  41.79 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.24 
 
 		 496 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.24 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.04 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  40.44 
 
 		 496 aa  346  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.72 
 
 		 530 aa  346  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.76 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.76 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.76 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.76 
 
 		 496 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.25 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.65 
 
 		 520 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.73 
 
 		 497 aa  339  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.86 
 
 		 493 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.95 
 
 		 507 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.83 
 
 		 496 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  40.8 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  39.96 
 
 		 538 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>