More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3523 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.94 
 
 		 496 aa  960    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  93.95 
 
 		 496 aa  972    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.53 
 
 		 496 aa  962    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.94 
 
 		 496 aa  965    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.94 
 
 		 496 aa  965    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  91.94 
 
 		 496 aa  965    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.79 
 
 		 530 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  97.78 
 
 		 496 aa  1012    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  97.98 
 
 		 496 aa  1016    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.36 
 
 		 495 aa  806    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 496 aa  1033    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.81 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  62.84 
 
 		 511 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.71 
 
 		 507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.21 
 
 		 497 aa  598  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3003  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.54 
 
 		 506 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.85 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.81 
 
 		 493 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  42.77 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  42.77 
 
 		 523 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  39.13 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.18 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.07 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.61 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  40.88 
 
 		 600 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.47 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.79 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.79 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.79 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.72 
 
 		 524 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.04 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.87 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  41.46 
 
 		 540 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  42.49 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  41.45 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.18 
 
 		 550 aa  347  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  41.83 
 
 		 536 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  41.06 
 
 		 555 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  40.24 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.11 
 
 		 547 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.55 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.55 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.55 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  40.51 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  41.06 
 
 		 555 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  41.06 
 
 		 556 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.63 
 
 		 540 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  41.46 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  41.36 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  40.76 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  40.76 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  40.34 
 
 		 539 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  41.91 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  37.16 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.19 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  40.76 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  40.13 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  39.74 
 
 		 538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  41.02 
 
 		 526 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  41.02 
 
 		 526 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.59 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  38.41 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  41.02 
 
 		 526 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  41.02 
 
 		 546 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  41.5 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  41.02 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  41.5 
 
 		 536 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  41.02 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.3 
 
 		 533 aa  336  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  41.14 
 
 		 539 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  40.6 
 
 		 546 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  40.64 
 
 		 539 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  41.02 
 
 		 546 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.03 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.43 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.03 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  39.8 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.79 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  40.67 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  39.22 
 
 		 533 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.27 
 
 		 499 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  37.92 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.59 
 
 		 553 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.47 
 
 		 527 aa  329  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  41.4 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.63 
 
 		 469 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.13 
 
 		 539 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.55 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.81 
 
 		 572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.53 
 
 		 543 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.03 
 
 		 551 aa  326  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  37 
 
 		 550 aa  326  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.88 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.78 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.64 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.52 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.8 
 
 		 550 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  38.51 
 
 		 522 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.63 
 
 		 532 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  38.98 
 
 		 564 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>