More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3003 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.53 
 
 		 497 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.18 
 
 		 530 aa  643    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3003  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 506 aa  1041    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.71 
 
 		 497 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.89 
 
 		 507 aa  624  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  59.96 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.75 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60 
 
 		 520 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.92 
 
 		 496 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.54 
 
 		 496 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  59.51 
 
 		 511 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.75 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.54 
 
 		 496 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.92 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.92 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.71 
 
 		 496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.85 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.58 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  41.68 
 
 		 529 aa  359  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.68 
 
 		 504 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  41.63 
 
 		 532 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  42.76 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  42.38 
 
 		 539 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  41.54 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  41.33 
 
 		 539 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  41.59 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  41.11 
 
 		 539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  41.81 
 
 		 523 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  41.74 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  41.11 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  42.15 
 
 		 536 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  41.11 
 
 		 539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.44 
 
 		 536 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  41.01 
 
 		 537 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  41.63 
 
 		 557 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.07 
 
 		 531 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  41.11 
 
 		 539 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  40.87 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  39.4 
 
 		 540 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.49 
 
 		 539 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  40.87 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  40.87 
 
 		 546 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  40.87 
 
 		 526 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  40.87 
 
 		 586 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  40.87 
 
 		 546 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  40.49 
 
 		 539 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  40.87 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  40.28 
 
 		 539 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  41.74 
 
 		 539 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.34 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  40 
 
 		 538 aa  330  4e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  41.48 
 
 		 536 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  41.48 
 
 		 546 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.36 
 
 		 543 aa  329  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.46 
 
 		 532 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  39.83 
 
 		 553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.21 
 
 		 525 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.21 
 
 		 525 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.21 
 
 		 525 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  41.4 
 
 		 556 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  36.31 
 
 		 525 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.37 
 
 		 539 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.91 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.42 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  40.55 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.42 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  41.18 
 
 		 555 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  37.4 
 
 		 543 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  40.95 
 
 		 554 aa  324  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.34 
 
 		 532 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  40.95 
 
 		 555 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.76 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.09 
 
 		 527 aa  323  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  41.87 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.72 
 
 		 541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.08 
 
 		 547 aa  320  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  40.99 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.97 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.83 
 
 		 534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.12 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.86 
 
 		 581 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.71 
 
 		 543 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.85 
 
 		 534 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.85 
 
 		 534 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  39.5 
 
 		 533 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.2 
 
 		 551 aa  312  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.07 
 
 		 534 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.94 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  38.63 
 
 		 564 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.35 
 
 		 524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.04 
 
 		 550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.71 
 
 		 572 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  39.23 
 
 		 522 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39 
 
 		 557 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  40.33 
 
 		 541 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.8 
 
 		 547 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.62 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.49 
 
 		 572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  39.65 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>