More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0567 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  59.13 
 
 		 555 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  61.9 
 
 		 539 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  64.63 
 
 		 532 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.48 
 
 		 536 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.64 
 
 		 547 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  61.74 
 
 		 540 aa  637    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  59.18 
 
 		 553 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.01 
 
 		 532 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.26 
 
 		 543 aa  905    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  62.8 
 
 		 526 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  64.02 
 
 		 539 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  60.43 
 
 		 537 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  62.8 
 
 		 557 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  63.55 
 
 		 539 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  61.9 
 
 		 539 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.7 
 
 		 539 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  61.35 
 
 		 556 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  62.67 
 
 		 539 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  62.8 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  62.53 
 
 		 536 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  62.8 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  62.8 
 
 		 586 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  63.15 
 
 		 539 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  61.69 
 
 		 539 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  63.49 
 
 		 557 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.78 
 
 		 541 aa  771    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.66 
 
 		 543 aa  920    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  58.95 
 
 		 555 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.58 
 
 		 551 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 541 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  61.28 
 
 		 536 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  62.8 
 
 		 526 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.22 
 
 		 543 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58 
 
 		 547 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.78 
 
 		 541 aa  951    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  62.8 
 
 		 526 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  83.3 
 
 		 541 aa  938    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  63.35 
 
 		 539 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.4 
 
 		 532 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  58.7 
 
 		 539 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.28 
 
 		 540 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.23 
 
 		 572 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  63.15 
 
 		 539 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  62.1 
 
 		 536 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  63.55 
 
 		 539 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  61.89 
 
 		 532 aa  668    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  61.9 
 
 		 546 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  56.53 
 
 		 546 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  61.3 
 
 		 554 aa  631  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  57.74 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.44 
 
 		 572 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  60.78 
 
 		 537 aa  621  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.17 
 
 		 577 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.37 
 
 		 581 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.51 
 
 		 553 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  55.11 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.39 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  53.58 
 
 		 564 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  52.26 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.68 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.22 
 
 		 526 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.33 
 
 		 551 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  53.74 
 
 		 519 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.92 
 
 		 543 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  51.08 
 
 		 550 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.89 
 
 		 550 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.48 
 
 		 529 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  50.1 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  50.1 
 
 		 523 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  49.9 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.99 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  53.76 
 
 		 526 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  53.28 
 
 		 548 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.76 
 
 		 529 aa  527  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.4 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.21 
 
 		 547 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.1 
 
 		 550 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.09 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.61 
 
 		 499 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  50.1 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  52.35 
 
 		 555 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.2 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  40.33 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.6 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.42 
 
 		 530 aa  345  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.38 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.29 
 
 		 534 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.29 
 
 		 534 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.29 
 
 		 534 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.18 
 
 		 531 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.67 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.7 
 
 		 507 aa  332  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.83 
 
 		 534 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.92 
 
 		 500 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.28 
 
 		 533 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.61 
 
 		 496 aa  329  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.61 
 
 		 496 aa  329  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5647  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.95 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5268  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.95 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5357  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.95 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>