More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0316 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 500 aa  993    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  49.36 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.14 
 
 		 572 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.9 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.6 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.11 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  43.16 
 
 		 546 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  43.08 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  43.08 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  43.08 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.86 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  42.8 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  44.09 
 
 		 532 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  43.39 
 
 		 555 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  45.18 
 
 		 537 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  42.65 
 
 		 536 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  43.59 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  42.66 
 
 		 539 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.25 
 
 		 532 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  41.98 
 
 		 539 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.25 
 
 		 532 aa  359  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  43.39 
 
 		 556 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  41.98 
 
 		 539 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  41.58 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  42.46 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  41.78 
 
 		 539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  47.4 
 
 		 540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  46.31 
 
 		 553 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.83 
 
 		 539 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  42.01 
 
 		 539 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.8 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  41.93 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.54 
 
 		 543 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  44.39 
 
 		 539 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  44.39 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  44.39 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.63 
 
 		 541 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.77 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.06 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.72 
 
 		 540 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  45.52 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  43.68 
 
 		 546 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  43.68 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  42.89 
 
 		 537 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  40.84 
 
 		 600 aa  332  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.97 
 
 		 581 aa  329  6e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.23 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.93 
 
 		 547 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.41 
 
 		 541 aa  320  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.59 
 
 		 577 aa  319  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  41.51 
 
 		 535 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.92 
 
 		 541 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  39.92 
 
 		 541 aa  302  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.84 
 
 		 542 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  38.95 
 
 		 564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.52 
 
 		 551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  34.72 
 
 		 523 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.48 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  34.3 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.1 
 
 		 527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  35.92 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  37.5 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  36.83 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.67 
 
 		 543 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  36.88 
 
 		 526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.02 
 
 		 550 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  34.02 
 
 		 550 aa  253  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.22 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  34.38 
 
 		 670 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.04 
 
 		 550 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.82 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  40.06 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.14 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  37.32 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.87 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.77 
 
 		 499 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.77 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.82 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.82 
 
 		 497 aa  163  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0131  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.71 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0899191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.71 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.03 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3332  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.79 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  31.69 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.44 
 
 		 507 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3674  hypothetical protein  27.87 
 
 		 522 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3679  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.84 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3656  hypothetical protein  28.18 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1562  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.75 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.38 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3436  hypothetical protein  28.18 
 
 		 522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3397  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.18 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3706  hypothetical protein  28.18 
 
 		 522 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>