More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0101 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.5 
 
 		 577 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 551 aa  1135    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.04 
 
 		 542 aa  755    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.42 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.85 
 
 		 581 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.39 
 
 		 543 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  54.43 
 
 		 539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.36 
 
 		 543 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  55.66 
 
 		 539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  56.05 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  55.66 
 
 		 539 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.66 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  55.98 
 
 		 536 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  54.38 
 
 		 523 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  55.31 
 
 		 557 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  54.25 
 
 		 600 aa  568  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  55.58 
 
 		 539 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  54.56 
 
 		 532 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  54.27 
 
 		 537 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  54.72 
 
 		 526 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  54.18 
 
 		 523 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  54.72 
 
 		 526 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  54.42 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.01 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.28 
 
 		 543 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  54.72 
 
 		 526 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  54.71 
 
 		 539 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  52.13 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  54.72 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  54.71 
 
 		 539 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  54.72 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.78 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  54.72 
 
 		 586 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  54.71 
 
 		 539 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  54.44 
 
 		 536 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.88 
 
 		 541 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  54.65 
 
 		 546 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  55.49 
 
 		 532 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  54.11 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  54.53 
 
 		 546 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  52.93 
 
 		 536 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  54.55 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  54.31 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.12 
 
 		 536 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.66 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  52.61 
 
 		 540 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.47 
 
 		 532 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  54.76 
 
 		 555 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.27 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  54.37 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  54.1 
 
 		 556 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.17 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.26 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.9 
 
 		 572 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  53.21 
 
 		 541 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  50.58 
 
 		 546 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.63 
 
 		 527 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.86 
 
 		 551 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.53 
 
 		 541 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  54.44 
 
 		 554 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  49.91 
 
 		 564 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  49.81 
 
 		 550 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.8 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  55.12 
 
 		 537 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.68 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  54.04 
 
 		 526 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  50.3 
 
 		 533 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  49.8 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  49.32 
 
 		 519 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.13 
 
 		 547 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.45 
 
 		 541 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.76 
 
 		 557 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  51.96 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.16 
 
 		 529 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  49.9 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  49.9 
 
 		 548 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.19 
 
 		 550 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  47.45 
 
 		 555 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.47 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.66 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.99 
 
 		 469 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3983  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.43 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.698806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.51 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.41 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.78 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.57 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.57 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.57 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.95 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.83 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.04 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.03 
 
 		 496 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.04 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  38.98 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  39.61 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.6 
 
 		 534 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.44 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.25 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.32 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>