More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000267 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  79.96 
 
 		 515 aa  782    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  100 
 
 		 466 aa  967    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.09 
 
 		 516 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.77 
 
 		 516 aa  757    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.31 
 
 		 516 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75.59 
 
 		 514 aa  752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.73 
 
 		 502 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.63 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  59.83 
 
 		 518 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.23 
 
 		 535 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.9 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.26 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.64 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.36 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.15 
 
 		 529 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  44.37 
 
 		 529 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  47.39 
 
 		 529 aa  345  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.61 
 
 		 496 aa  315  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.89 
 
 		 492 aa  312  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.54 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  39.88 
 
 		 505 aa  210  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  38.01 
 
 		 503 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  34.48 
 
 		 500 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.92 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  36.54 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.27 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.66 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  33.81 
 
 		 510 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.1 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  37.35 
 
 		 502 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.1 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  37.83 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  37.74 
 
 		 741 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.74 
 
 		 502 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  34.58 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  33.5 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  38.01 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  38.01 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  32.45 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  36.9 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.45 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.6 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.44 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  32.6 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  36.99 
 
 		 685 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.33 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.18 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.02 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  33.71 
 
 		 537 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  37.58 
 
 		 747 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.73 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.43 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  33.89 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.71 
 
 		 496 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  32.96 
 
 		 535 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.49 
 
 		 534 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  33.14 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.76 
 
 		 509 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  33.14 
 
 		 539 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.86 
 
 		 536 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  32.92 
 
 		 509 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.05 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  33.43 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  32.86 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.16 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.55 
 
 		 530 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  33.24 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.14 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  32.86 
 
 		 539 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  32.57 
 
 		 539 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  32.57 
 
 		 539 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.86 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.14 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  32.86 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.14 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.7 
 
 		 520 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  33.14 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  35.18 
 
 		 501 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.48 
 
 		 495 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  36.68 
 
 		 681 aa  176  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.4 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 496 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.84 
 
 		 581 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.05 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.33 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  31.34 
 
 		 538 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.92 
 
 		 533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.23 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  32.57 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.55 
 
 		 507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  32.57 
 
 		 557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  32.57 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  32.57 
 
 		 586 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  32.57 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  32.57 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  32.57 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.44 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>