More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2315 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.58 
 
 		 545 aa  771    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 546 aa  1133    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.33 
 
 		 535 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  74.54 
 
 		 547 aa  820    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.24 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.93 
 
 		 502 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.91 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  59.26 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.36 
 
 		 516 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  58.52 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  61.14 
 
 		 518 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.64 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.39 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  48.08 
 
 		 529 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.98 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  47.8 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  41.41 
 
 		 496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.41 
 
 		 492 aa  306  7e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.67 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.54 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.68 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  34.44 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.44 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.74 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.93 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.76 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.8 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.83 
 
 		 507 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  28.08 
 
 		 497 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.94 
 
 		 500 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  34.36 
 
 		 507 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  34.36 
 
 		 507 aa  170  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.54 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.54 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.66 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.93 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  32.09 
 
 		 502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  32.54 
 
 		 502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  34.02 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  33.43 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  34.45 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.18 
 
 		 507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  32.65 
 
 		 442 aa  167  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.91 
 
 		 444 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  31.25 
 
 		 510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.82 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  34.02 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.94 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.86 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  30.94 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.36 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.63 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.32 
 
 		 466 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.14 
 
 		 442 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  34.75 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 747 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 447 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  31.06 
 
 		 536 aa  163  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  32.31 
 
 		 444 aa  163  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.42 
 
 		 442 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  26.76 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.16 
 
 		 502 aa  163  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.42 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  33.54 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.25 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.25 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.25 
 
 		 446 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.91 
 
 		 442 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  32.34 
 
 		 536 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  30.31 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.99 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  32.58 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.04 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  31.78 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  31.78 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  32.58 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.7 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  32.21 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  31.74 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.52 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.03 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  33.23 
 
 		 543 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.08 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  31.29 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  31.29 
 
 		 557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  31.29 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2487  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.69 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  33.96 
 
 		 741 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.41 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  30.58 
 
 		 670 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  31.29 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2536  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.69 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0256797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>