More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0489 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  64.24 
 
 		 515 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 502 aa  1023    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.29 
 
 		 510 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.37 
 
 		 514 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  63.53 
 
 		 518 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.1 
 
 		 516 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.71 
 
 		 516 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.16 
 
 		 516 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  65.73 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.34 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.93 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.48 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.61 
 
 		 545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.59 
 
 		 547 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.63 
 
 		 529 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  49.17 
 
 		 529 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  46.88 
 
 		 529 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.86 
 
 		 496 aa  336  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.36 
 
 		 492 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  40.75 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  40.75 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  37.28 
 
 		 502 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  36.14 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.76 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  36.99 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  36.99 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.7 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  36.81 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.99 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.69 
 
 		 503 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  34.84 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  34.29 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  37.14 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.38 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.74 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.42 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.65 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  34.84 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  35.51 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.16 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.56 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  34.18 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  34.56 
 
 		 500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.9 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  32.64 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.24 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.63 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.16 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  33.71 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.16 
 
 		 447 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.25 
 
 		 472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.16 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.43 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.16 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.53 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.53 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.53 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.43 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.25 
 
 		 458 aa  183  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.77 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.08 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  34.04 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  33.92 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  37.33 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.57 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.58 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.67 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.98 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.06 
 
 		 455 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.93 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.01 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  36.45 
 
 		 539 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  36.14 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  34.54 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  36.14 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  36.14 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  35.65 
 
 		 539 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  35.65 
 
 		 539 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  36.14 
 
 		 539 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  33.8 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  34.07 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  34.07 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.84 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.26 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.93 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  34.07 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  34.07 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.83 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  34.07 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  34.07 
 
 		 546 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  32.7 
 
 		 536 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  33.8 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  34.42 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  34.72 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  34.53 
 
 		 539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  36.21 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  36.83 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  33.82 
 
 		 600 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>