More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0954 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  75.94 
 
 		 529 aa  840    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 529 aa  1092    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  89.41 
 
 		 529 aa  984    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.81 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.63 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.6 
 
 		 535 aa  359  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  50.26 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.35 
 
 		 516 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  49.6 
 
 		 518 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.88 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  47.39 
 
 		 466 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.45 
 
 		 545 aa  343  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.12 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.11 
 
 		 516 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.99 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.99 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.8 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.49 
 
 		 547 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.21 
 
 		 440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  33.05 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  36.9 
 
 		 502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.31 
 
 		 503 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.12 
 
 		 503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  40.32 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  41.03 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  40.65 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  33.4 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  40.32 
 
 		 510 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  40.32 
 
 		 510 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  34.71 
 
 		 507 aa  209  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  34.71 
 
 		 507 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.32 
 
 		 502 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.36 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  33.66 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  35.13 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  35.13 
 
 		 500 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  40.06 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.39 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  38.05 
 
 		 530 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  32.28 
 
 		 503 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.01 
 
 		 447 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.14 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.14 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  39.74 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.1 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.14 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.99 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  33.42 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.25 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.66 
 
 		 500 aa  200  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.98 
 
 		 456 aa  200  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.29 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.13 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  32.05 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.37 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.45 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.28 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.01 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  39.43 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.77 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.89 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.87 
 
 		 442 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.08 
 
 		 509 aa  190  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  35.52 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  36.52 
 
 		 441 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  36.03 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.03 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.81 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.66 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 447 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.51 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.05 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.77 
 
 		 440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  35.07 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  38.67 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  35.71 
 
 		 741 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.68 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.55 
 
 		 442 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.09 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  37.58 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.05 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.99 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 534 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 534 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  37.2 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.48 
 
 		 534 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  33.54 
 
 		 529 aa  179  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.73 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.03 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.97 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.73 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.73 
 
 		 496 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.18 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.39 
 
 		 496 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.39 
 
 		 496 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>