More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0781 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  68.96 
 
 
510 aa  706    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  66.27 
 
 
510 aa  662    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  78.93 
 
 
502 aa  828    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  68.96 
 
 
510 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  73.45 
 
 
505 aa  792    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  75.35 
 
 
503 aa  807    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  76.29 
 
 
502 aa  795    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 
503 aa  1035    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  68.76 
 
 
510 aa  704    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  79.72 
 
 
503 aa  846    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  69.94 
 
 
510 aa  731    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  59.12 
 
 
500 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  57.52 
 
 
530 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  59.96 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  58.59 
 
 
507 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.04 
 
 
502 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.37 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  57.37 
 
 
507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.65 
 
 
501 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.02 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  58.43 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  58.43 
 
 
507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  54.82 
 
 
500 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  54.82 
 
 
500 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  57.86 
 
 
501 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  56.94 
 
 
497 aa  555  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  55.42 
 
 
509 aa  548  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  55.42 
 
 
509 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.13 
 
 
509 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  48.9 
 
 
747 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.88 
 
 
741 aa  313  6.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.36 
 
 
712 aa  309  8e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.32 
 
 
693 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  47.43 
 
 
685 aa  286  7e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  47.6 
 
 
681 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  44.08 
 
 
684 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.04 
 
 
1505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  38.9 
 
 
1516 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 
1499 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 
1499 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.83 
 
 
1511 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.9 
 
 
1516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.09 
 
 
1533 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  41.16 
 
 
1518 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.97 
 
 
1546 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.31 
 
 
1510 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  39.48 
 
 
1515 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  35.92 
 
 
1485 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.64 
 
 
1519 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.59 
 
 
1577 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.67 
 
 
1554 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  40.88 
 
 
1572 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  39.76 
 
 
1519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  40.24 
 
 
1478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.88 
 
 
1572 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.83 
 
 
1584 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  37.09 
 
 
1487 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.23 
 
 
1518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  41.41 
 
 
1478 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  39.57 
 
 
1477 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.38 
 
 
1558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  41.1 
 
 
1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.58 
 
 
1512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  38.67 
 
 
1482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  41.01 
 
 
1526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5479  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.12 
 
 
1526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.61 
 
 
1527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.48 
 
 
1502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  37.69 
 
 
1487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.61 
 
 
1489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.22 
 
 
1510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.37 
 
 
1567 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  39.63 
 
 
1478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.66 
 
 
1524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.61 
 
 
1518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  39.55 
 
 
1564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.61 
 
 
1518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.61 
 
 
1518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  40.43 
 
 
1546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.1 
 
 
1527 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.32 
 
 
1509 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  39.63 
 
 
1478 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 
1478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 
1478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  39.94 
 
 
1478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  39.94 
 
 
1478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  41.72 
 
 
1514 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  35.99 
 
 
1487 aa  213  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  39.63 
 
 
1478 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.42 
 
 
1527 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.12 
 
 
1525 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  40.64 
 
 
1563 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  38.37 
 
 
1482 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  39.27 
 
 
1571 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.21 
 
 
1502 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 
1483 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  37.89 
 
 
1530 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  38.07 
 
 
1583 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  41.27 
 
 
1512 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  38.35 
 
 
1583 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>