More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1884 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  72.87 
 
 		 747 aa  1086    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.4 
 
 		 741 aa  653    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  100 
 
 		 712 aa  1436    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  41.16 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  40.86 
 
 		 681 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.25 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  40.41 
 
 		 684 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  49.55 
 
 		 502 aa  327  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.5 
 
 		 503 aa  316  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  45.45 
 
 		 505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  49.85 
 
 		 502 aa  313  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  50.15 
 
 		 502 aa  313  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.37 
 
 		 501 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  43.57 
 
 		 497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  50.75 
 
 		 530 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  48.36 
 
 		 503 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  49.26 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  45.21 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.36 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  48.36 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  48.5 
 
 		 510 aa  308  3e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.26 
 
 		 500 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  49.26 
 
 		 500 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  49.85 
 
 		 507 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  45.38 
 
 		 503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  48.36 
 
 		 507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.76 
 
 		 507 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  48.88 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  48.56 
 
 		 509 aa  301  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  46.27 
 
 		 500 aa  300  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  46.99 
 
 		 507 aa  300  9e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  46.99 
 
 		 507 aa  300  9e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  50.6 
 
 		 501 aa  298  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.46 
 
 		 502 aa  296  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.47 
 
 		 509 aa  293  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  47.9 
 
 		 510 aa  280  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  38.29 
 
 		 1516 aa  200  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  35.68 
 
 		 1524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.88 
 
 		 1519 aa  197  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 		 1533 aa  197  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.5 
 
 		 1510 aa  197  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.29 
 
 		 1510 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  34.16 
 
 		 1512 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  34.16 
 
 		 1512 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  37.97 
 
 		 1512 aa  194  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.73 
 
 		 1513 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  37.97 
 
 		 1511 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1512 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  37.22 
 
 		 1499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.98 
 
 		 1505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  37.22 
 
 		 1499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  36.81 
 
 		 1507 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  34.59 
 
 		 1478 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.3 
 
 		 1483 aa  190  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.28 
 
 		 1510 aa  190  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  35.12 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  35.39 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  33.41 
 
 		 1509 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  34.35 
 
 		 1473 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  35.12 
 
 		 1478 aa  187  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  34.85 
 
 		 1478 aa  187  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  37.79 
 
 		 1510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  37.58 
 
 		 2126 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.46 
 
 		 1518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  36.9 
 
 		 1510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  36.1 
 
 		 1512 aa  184  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  38.39 
 
 		 1554 aa  183  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  36.66 
 
 		 1510 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  37.74 
 
 		 1508 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.06 
 
 		 1469 aa  183  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  38.51 
 
 		 1546 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.98 
 
 		 1474 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  37.42 
 
 		 1485 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.1 
 
 		 1527 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  34.81 
 
 		 1477 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 1494 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.79 
 
 		 1567 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.99 
 
 		 1546 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.39 
 
 		 1539 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.88 
 
 		 1527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  37.07 
 
 		 1507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.49 
 
 		 1577 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  35.92 
 
 		 1513 aa  181  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  35.9 
 
 		 1530 aa  180  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2319  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.87 
 
 		 1524 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.189899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.18 
 
 		 492 aa  180  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.33 
 
 		 1511 aa  180  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  32.66 
 
 		 1554 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  32.08 
 
 		 1573 aa  180  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.65 
 
 		 1558 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.69 
 
 		 1487 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 1487 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.99 
 
 		 1509 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  35.87 
 
 		 1498 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  35.16 
 
 		 1550 aa  179  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>