More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0523 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.25 
 
 		 501 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  64.02 
 
 		 500 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  64.95 
 
 		 500 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  66.14 
 
 		 501 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  70.22 
 
 		 502 aa  720    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.25 
 
 		 507 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  69.66 
 
 		 502 aa  725    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  63.31 
 
 		 507 aa  651    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  64.61 
 
 		 500 aa  678    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 507 aa  1038    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.61 
 
 		 500 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  64.53 
 
 		 497 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 507 aa  1038    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  64.92 
 
 		 507 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  62.05 
 
 		 509 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  62.85 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  61.65 
 
 		 509 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  59.96 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.73 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  59.3 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  59.1 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.1 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  59.3 
 
 		 510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  57.94 
 
 		 503 aa  598  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  59 
 
 		 502 aa  588  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  58.43 
 
 		 503 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  57.34 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  56.6 
 
 		 502 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  53 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.06 
 
 		 712 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  46.43 
 
 		 747 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  45.48 
 
 		 681 aa  276  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  44.77 
 
 		 741 aa  276  7e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  38.98 
 
 		 685 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.86 
 
 		 693 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  44.55 
 
 		 684 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.56 
 
 		 1519 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.87 
 
 		 1510 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.72 
 
 		 1510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.57 
 
 		 1577 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  41.62 
 
 		 1583 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  42.63 
 
 		 1583 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  36.49 
 
 		 1512 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.49 
 
 		 1512 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 1488 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  42.63 
 
 		 1583 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  39.34 
 
 		 1507 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  42.39 
 
 		 1567 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.43 
 
 		 1574 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  36.52 
 
 		 1512 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.82 
 
 		 1558 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  41.19 
 
 		 1524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.26 
 
 		 1572 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  43.26 
 
 		 1572 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  37.67 
 
 		 1478 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  41.87 
 
 		 1519 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  43.48 
 
 		 1571 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  35.35 
 
 		 1487 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  36.21 
 
 		 1478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.37 
 
 		 1489 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  38.75 
 
 		 1478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  38.48 
 
 		 1478 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.53 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 1484 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.48 
 
 		 1518 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.88 
 
 		 1520 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.48 
 
 		 1518 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.19 
 
 		 1474 aa  224  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 1486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  37.43 
 
 		 1477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  36.21 
 
 		 1478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.48 
 
 		 1518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 		 1526 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.51 
 
 		 1524 aa  223  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 1486 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  37.67 
 
 		 1478 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.17 
 
 		 1533 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  40.4 
 
 		 1580 aa  223  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 1460 aa  223  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  41.46 
 
 		 1499 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  41.46 
 
 		 1499 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.99 
 
 		 1502 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  42.54 
 
 		 1546 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  39.7 
 
 		 1513 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.63 
 
 		 1512 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 1482 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  41.69 
 
 		 1574 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.34 
 
 		 1509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  36.72 
 
 		 1487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 		 1528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 1482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 1482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 1477 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  40.54 
 
 		 1518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.94 
 
 		 1567 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  40.79 
 
 		 1478 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>