More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1640 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  48.85 
 
 		 1510 aa  1361    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  41.91 
 
 		 1478 aa  1135    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  42.35 
 
 		 1478 aa  1143    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  42.24 
 
 		 1478 aa  1136    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.11 
 
 		 1478 aa  1141    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.37 
 
 		 1478 aa  1144    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.91 
 
 		 1518 aa  1243    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 1519 aa  3100    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.9 
 
 		 1499 aa  1089    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  48.16 
 
 		 1513 aa  1320    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  48.98 
 
 		 1510 aa  1353    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  42.24 
 
 		 1478 aa  1137    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  42.28 
 
 		 1478 aa  1135    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  42.18 
 
 		 1477 aa  1130    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  46.94 
 
 		 1498 aa  1262    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  41.91 
 
 		 1478 aa  1136    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  42.18 
 
 		 1478 aa  1138    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  59.84 
 
 		 1510 aa  1784    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  42.08 
 
 		 1478 aa  1147    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  49.21 
 
 		 1507 aa  1346    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  49.01 
 
 		 1507 aa  1304    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.85 
 
 		 1505 aa  1134    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.88 
 
 		 1468 aa  531  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  30.74 
 
 		 1482 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  30.26 
 
 		 1487 aa  526  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  29.1 
 
 		 1526 aa  522  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  31.48 
 
 		 1483 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.64 
 
 		 1526 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.34 
 
 		 1483 aa  520  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  31.61 
 
 		 1484 aa  520  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  31.31 
 
 		 1562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.57 
 
 		 1519 aa  516  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  30.73 
 
 		 1569 aa  512  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 		 1486 aa  511  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  30.01 
 
 		 1487 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.1 
 
 		 1554 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.44 
 
 		 1508 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.89 
 
 		 1487 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  30.04 
 
 		 1488 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.16 
 
 		 1554 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1483 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.75 
 
 		 1487 aa  505  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  30.25 
 
 		 1486 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.03 
 
 		 1524 aa  506  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.1 
 
 		 1527 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  31.43 
 
 		 1486 aa  505  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  29.72 
 
 		 1482 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.85 
 
 		 1525 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  30.46 
 
 		 1486 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  30.69 
 
 		 1482 aa  503  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.65 
 
 		 1520 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1548 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  30.62 
 
 		 1482 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  31.36 
 
 		 1462 aa  502  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.56 
 
 		 1469 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  30.25 
 
 		 1486 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.83 
 
 		 1520 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.44 
 
 		 1536 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  30.54 
 
 		 1486 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.15 
 
 		 1513 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1482 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  31.29 
 
 		 1554 aa  500  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  30.74 
 
 		 1546 aa  499  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  30.66 
 
 		 1482 aa  499  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  30.92 
 
 		 1491 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  30.37 
 
 		 1512 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  30.27 
 
 		 1480 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  30.55 
 
 		 1482 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  29.79 
 
 		 1487 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  30.6 
 
 		 1482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  29.95 
 
 		 1486 aa  495  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.72 
 
 		 1542 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1482 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.67 
 
 		 1525 aa  496  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  30.6 
 
 		 1482 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  30.51 
 
 		 1571 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.73 
 
 		 1533 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  30.24 
 
 		 1516 aa  496  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0612  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.28 
 
 		 1539 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  30.49 
 
 		 1486 aa  492  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.53 
 
 		 1518 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.88 
 
 		 1516 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  31.43 
 
 		 1546 aa  493  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  30.57 
 
 		 1487 aa  493  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.6 
 
 		 1518 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.62 
 
 		 1519 aa  492  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.66 
 
 		 1489 aa  493  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  30.41 
 
 		 1507 aa  492  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  29.38 
 
 		 1525 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  29.82 
 
 		 1482 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.6 
 
 		 1518 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.35 
 
 		 1501 aa  489  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1485 aa  489  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1485 aa  489  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1462 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.3 
 
 		 1530 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  29.3 
 
 		 1481 aa  490  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  30.05 
 
 		 1535 aa  489  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  31.17 
 
 		 1485 aa  489  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  30.16 
 
 		 1482 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>