More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16300 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  66.73 
 
 
500 aa  713    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  64.26 
 
 
509 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  74.25 
 
 
502 aa  767    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  64.46 
 
 
509 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  65.06 
 
 
509 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  67.47 
 
 
507 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  64.95 
 
 
507 aa  665    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  72.46 
 
 
501 aa  729    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  69.17 
 
 
502 aa  705    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 
500 aa  1033    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  66.94 
 
 
500 aa  713    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  66.53 
 
 
500 aa  711    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  64.85 
 
 
497 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  64.95 
 
 
507 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  69.06 
 
 
507 aa  725    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  67.53 
 
 
507 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  72.47 
 
 
501 aa  750    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  59.28 
 
 
530 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  59.49 
 
 
510 aa  617  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  59.12 
 
 
503 aa  608  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.48 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  58.5 
 
 
502 aa  595  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  58.32 
 
 
510 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  57.93 
 
 
510 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.32 
 
 
510 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  57.58 
 
 
503 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  57.73 
 
 
510 aa  569  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  57.75 
 
 
502 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  56.77 
 
 
505 aa  565  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  43.06 
 
 
747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.27 
 
 
712 aa  300  5e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  46.11 
 
 
741 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  39.9 
 
 
685 aa  276  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  39.62 
 
 
681 aa  271  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.66 
 
 
693 aa  270  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  44.6 
 
 
1546 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  44.16 
 
 
684 aa  249  7e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  43.94 
 
 
1554 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.58 
 
 
1533 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  44 
 
 
1519 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.86 
 
 
1510 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.55 
 
 
1567 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  40.94 
 
 
1486 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.75 
 
 
1524 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.52 
 
 
1483 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  40.22 
 
 
1489 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  38.99 
 
 
1485 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.23 
 
 
1489 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.53 
 
 
1577 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  40.44 
 
 
1486 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  42.45 
 
 
1516 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  41.74 
 
 
1515 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  41.96 
 
 
1482 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  41.02 
 
 
1499 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  42.77 
 
 
1516 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  41.02 
 
 
1499 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.99 
 
 
1487 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  41.23 
 
 
1482 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  42.25 
 
 
1486 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.68 
 
 
1509 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  42.51 
 
 
1583 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  37.53 
 
 
1572 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  42.51 
 
 
1583 aa  229  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.53 
 
 
1572 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  41.23 
 
 
1482 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  41.23 
 
 
1482 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  42.12 
 
 
1482 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0706  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.79 
 
 
1512 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.985465  normal  0.0881297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.47 
 
 
1511 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  43.79 
 
 
1482 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  39.46 
 
 
1512 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.09 
 
 
1526 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  39.46 
 
 
1512 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  38.73 
 
 
1486 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.46 
 
 
1512 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  39.94 
 
 
1477 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  42.09 
 
 
1583 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.97 
 
 
1486 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  38.73 
 
 
1486 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.89 
 
 
1574 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  42.68 
 
 
1563 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.31 
 
 
1518 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  41.46 
 
 
1482 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.14 
 
 
1574 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  38.73 
 
 
1487 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  40.5 
 
 
1507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  41.86 
 
 
1564 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  43.35 
 
 
1533 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.69 
 
 
1574 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  38.99 
 
 
1487 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  42.22 
 
 
1574 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  42.6 
 
 
1484 aa  226  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3776  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.94 
 
 
1512 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  43 
 
 
1482 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  42.04 
 
 
1526 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.04 
 
 
1575 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  41.87 
 
 
1573 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  43 
 
 
1482 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  38.97 
 
 
1510 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  40.98 
 
 
1507 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>