More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0729 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  44.59 
 
 		 1478 aa  1243    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  73.29 
 
 		 1510 aa  2189    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  49.07 
 
 		 1498 aa  1319    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  44.58 
 
 		 1478 aa  1239    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  44.44 
 
 		 1478 aa  1241    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  44.59 
 
 		 1478 aa  1246    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  44.39 
 
 		 1478 aa  1243    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  44.42 
 
 		 1478 aa  1232    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.01 
 
 		 1519 aa  1326    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  66.13 
 
 		 1513 aa  1902    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  44.28 
 
 		 1478 aa  1230    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.62 
 
 		 1505 aa  1297    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.42 
 
 		 1510 aa  1306    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  73.79 
 
 		 1510 aa  2214    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  44.53 
 
 		 1478 aa  1243    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.08 
 
 		 1518 aa  1311    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.52 
 
 		 1499 aa  1191    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  47.16 
 
 		 1477 aa  1061    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 1507 aa  3053    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  44.51 
 
 		 1478 aa  1252    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  44.97 
 
 		 1478 aa  1240    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  75.48 
 
 		 1507 aa  2248    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32 
 
 		 1572 aa  558  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.74 
 
 		 1577 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32 
 
 		 1572 aa  558  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.28 
 
 		 1482 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  31.97 
 
 		 1482 aa  553  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  31.51 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  32.26 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31.94 
 
 		 1482 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.95 
 
 		 1511 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  31.82 
 
 		 1482 aa  548  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  32.19 
 
 		 1482 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  32.19 
 
 		 1482 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  31.93 
 
 		 1563 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  32.04 
 
 		 1462 aa  546  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  31.97 
 
 		 1462 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.41 
 
 		 1482 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  31.56 
 
 		 1483 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.65 
 
 		 1474 aa  536  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  32.53 
 
 		 1491 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.51 
 
 		 1489 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  32.14 
 
 		 1484 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.49 
 
 		 1571 aa  535  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  30.94 
 
 		 1482 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  31.81 
 
 		 1564 aa  535  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 1482 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.04 
 
 		 1487 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  31.72 
 
 		 1462 aa  533  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  32.44 
 
 		 1485 aa  532  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.19 
 
 		 1482 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.63 
 
 		 1482 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.72 
 
 		 1539 aa  533  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 		 1487 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.46 
 
 		 1487 aa  533  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  31.07 
 
 		 1542 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  31.95 
 
 		 1494 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.69 
 
 		 1519 aa  529  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.28 
 
 		 1486 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  31.85 
 
 		 1489 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  31.78 
 
 		 1477 aa  526  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.29 
 
 		 1527 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3758  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 		 1521 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00101986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.53 
 
 		 1525 aa  526  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.12 
 
 		 1520 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  31.77 
 
 		 1483 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  32.11 
 
 		 1546 aa  526  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  31.92 
 
 		 1554 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.26 
 
 		 1487 aa  526  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.35 
 
 		 1486 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  31.2 
 
 		 1481 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  30.89 
 
 		 1481 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  30.36 
 
 		 1486 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  31.13 
 
 		 1481 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  31.11 
 
 		 1488 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  30.47 
 
 		 1486 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  30.84 
 
 		 1481 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  31.32 
 
 		 1583 aa  520  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.36 
 
 		 1524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.82 
 
 		 1526 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  30.03 
 
 		 1486 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  30.93 
 
 		 1481 aa  516  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.09 
 
 		 1481 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.77 
 
 		 1524 aa  516  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.23 
 
 		 1550 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  30.23 
 
 		 1486 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  31.06 
 
 		 1486 aa  513  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  29.05 
 
 		 1496 aa  512  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  29.05 
 
 		 1495 aa  513  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000781352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.41 
 
 		 1533 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  30.71 
 
 		 1525 aa  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  30.87 
 
 		 1481 aa  513  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  29.05 
 
 		 1495 aa  512  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.71 
 
 		 1574 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  31.04 
 
 		 1583 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  30.8 
 
 		 1482 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  30.68 
 
 		 1481 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3875  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.68 
 
 		 1566 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146971 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.29 
 
 		 1469 aa  509  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.68 
 
 		 1475 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>