More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2944 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  66.73 
 
 		 1510 aa  1971    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  44.73 
 
 		 1478 aa  1220    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  44.37 
 
 		 1478 aa  1221    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  44.57 
 
 		 1478 aa  1229    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  44.5 
 
 		 1478 aa  1221    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  44.72 
 
 		 1477 aa  1224    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  48.59 
 
 		 1498 aa  1316    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.72 
 
 		 1505 aa  1276    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.16 
 
 		 1519 aa  1351    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.32 
 
 		 1510 aa  1296    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.59 
 
 		 1518 aa  1299    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  44.57 
 
 		 1478 aa  1226    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  100 
 
 		 1513 aa  3068    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  67.34 
 
 		 1510 aa  1988    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  44.44 
 
 		 1478 aa  1223    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  44.36 
 
 		 1478 aa  1224    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  44.05 
 
 		 1478 aa  1205    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  44.73 
 
 		 1478 aa  1220    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.81 
 
 		 1499 aa  1170    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  68.14 
 
 		 1507 aa  2020    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  66.2 
 
 		 1507 aa  1911    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  44.1 
 
 		 1478 aa  1205    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.79 
 
 		 1511 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  32.47 
 
 		 1484 aa  575  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.96 
 
 		 1487 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.01 
 
 		 1487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  32.05 
 
 		 1477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.92 
 
 		 1482 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  32.21 
 
 		 1483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  32.14 
 
 		 1487 aa  566  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  32.21 
 
 		 1481 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.3 
 
 		 1536 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  31.39 
 
 		 1482 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  32.05 
 
 		 1489 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.72 
 
 		 1519 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  32.15 
 
 		 1542 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  32.17 
 
 		 1481 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  31.8 
 
 		 1482 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 1482 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31.6 
 
 		 1482 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  30.95 
 
 		 1486 aa  556  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  31.92 
 
 		 1481 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  31.48 
 
 		 1462 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  31.16 
 
 		 1482 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  31 
 
 		 1482 aa  555  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  31.48 
 
 		 1462 aa  552  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  31.28 
 
 		 1482 aa  552  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.76 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  31.64 
 
 		 1462 aa  553  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  32.44 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  32.5 
 
 		 1483 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  30.86 
 
 		 1488 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  31.68 
 
 		 1482 aa  552  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  31.62 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.62 
 
 		 1482 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  31.78 
 
 		 1481 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.5 
 
 		 1474 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  32.3 
 
 		 1480 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1577 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.35 
 
 		 1482 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  31.37 
 
 		 1482 aa  549  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  31.23 
 
 		 1572 aa  545  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  31.12 
 
 		 1563 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1572 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.34 
 
 		 1520 aa  546  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.51 
 
 		 1554 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  31.58 
 
 		 1481 aa  546  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.71 
 
 		 1525 aa  546  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  31.33 
 
 		 1486 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  31.65 
 
 		 1481 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  31.66 
 
 		 1486 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  31.53 
 
 		 1583 aa  542  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  31.72 
 
 		 1481 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.54 
 
 		 1554 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.54 
 
 		 1527 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  31.53 
 
 		 1583 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  31.55 
 
 		 1486 aa  543  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 1486 aa  543  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  30.78 
 
 		 1485 aa  542  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  31.69 
 
 		 1481 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  31.58 
 
 		 1481 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  31.39 
 
 		 1583 aa  541  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  30.78 
 
 		 1535 aa  542  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  30.78 
 
 		 1485 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.03 
 
 		 1571 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  32.9 
 
 		 1546 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.35 
 
 		 1481 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.54 
 
 		 1507 aa  536  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  30.84 
 
 		 1461 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.59 
 
 		 1530 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  30.69 
 
 		 1493 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.03 
 
 		 1536 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  31.39 
 
 		 1564 aa  536  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.24 
 
 		 1527 aa  536  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  31.26 
 
 		 1553 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.62 
 
 		 1574 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  32.03 
 
 		 1546 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.53 
 
 		 1487 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 		 1580 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  31.4 
 
 		 1486 aa  533  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>