More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1226 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  47.64 
 
 
1510 aa  1267    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  48.23 
 
 
1478 aa  1326    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  48.8 
 
 
1478 aa  1324    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  48.17 
 
 
1478 aa  1321    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  48.23 
 
 
1478 aa  1326    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  48.17 
 
 
1478 aa  1325    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.95 
 
 
1510 aa  1154    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  48.2 
 
 
1478 aa  1325    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  48.33 
 
 
1507 aa  1273    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  45.74 
 
 
1513 aa  1186    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 
1499 aa  3077    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.27 
 
 
1518 aa  1297    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  47.07 
 
 
1510 aa  1251    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  47.42 
 
 
1498 aa  1285    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  48.17 
 
 
1478 aa  1322    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  48.37 
 
 
1478 aa  1331    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  47.41 
 
 
1477 aa  1319    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.9 
 
 
1519 aa  1124    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.87 
 
 
1505 aa  1351    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  48.2 
 
 
1478 aa  1325    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  46.55 
 
 
1507 aa  1204    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  48.17 
 
 
1478 aa  1324    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.89 
 
 
1486 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  31.22 
 
 
1482 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.21 
 
 
1482 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.48 
 
 
1482 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  30.65 
 
 
1483 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  30.74 
 
 
1482 aa  525  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  31.97 
 
 
1483 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.51 
 
 
1486 aa  523  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.83 
 
 
1550 aa  517  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 
1554 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  31.11 
 
 
1482 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  31 
 
 
1554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.42 
 
 
1482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.05 
 
 
1507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  31.64 
 
 
1480 aa  516  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  31.01 
 
 
1487 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  31.63 
 
 
1481 aa  516  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.01 
 
 
1487 aa  515  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.11 
 
 
1482 aa  516  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.02 
 
 
1487 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  30.42 
 
 
1481 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.9 
 
 
1527 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.14 
 
 
1483 aa  512  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  29.5 
 
 
1526 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  30.84 
 
 
1482 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.79 
 
 
1487 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  30.47 
 
 
1481 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.81 
 
 
1529 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  30.89 
 
 
1494 aa  509  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  30.38 
 
 
1481 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  31.62 
 
 
1482 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 
1574 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  30.87 
 
 
1482 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  31.02 
 
 
1482 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 
1482 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.02 
 
 
1482 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31 
 
 
1482 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  30.55 
 
 
1486 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  30.5 
 
 
1542 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  30.89 
 
 
1462 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  31.31 
 
 
1486 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  30.83 
 
 
1482 aa  506  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  30.46 
 
 
1562 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  30.04 
 
 
1525 aa  506  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  30.43 
 
 
1486 aa  505  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  30.89 
 
 
1485 aa  506  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  30.49 
 
 
1486 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  30.45 
 
 
1481 aa  506  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.73 
 
 
1572 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  30.53 
 
 
1486 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  30.95 
 
 
1461 aa  503  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  30.31 
 
 
1481 aa  503  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  30.96 
 
 
1462 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3875  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 
1566 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146971 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.02 
 
 
1475 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  30.54 
 
 
1481 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  31.73 
 
 
1572 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.67 
 
 
1468 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  31.87 
 
 
1533 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  30.48 
 
 
1481 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.51 
 
 
1533 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  30.02 
 
 
1571 aa  499  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.75 
 
 
1577 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.76 
 
 
1551 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  30.78 
 
 
1567 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.02 
 
 
1526 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  30.63 
 
 
1536 aa  495  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.56 
 
 
1574 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.32 
 
 
1539 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.79 
 
 
1520 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  30.05 
 
 
1485 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  31.17 
 
 
1573 aa  495  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  29.83 
 
 
1546 aa  495  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3758  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.26 
 
 
1521 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00101986  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.1 
 
 
1506 aa  494  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  30.11 
 
 
1485 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  30.99 
 
 
1514 aa  496  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  31.23 
 
 
1484 aa  495  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>