More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3450 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  46.08 
 
 		 1478 aa  1304    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  100 
 
 		 1510 aa  3062    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.64 
 
 		 1499 aa  1236    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  46.08 
 
 		 1478 aa  1304    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  45.83 
 
 		 1478 aa  1300    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  45.9 
 
 		 1478 aa  1306    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  45.78 
 
 		 1478 aa  1300    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  46.23 
 
 		 1478 aa  1289    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  46.16 
 
 		 1478 aa  1292    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  66.73 
 
 		 1513 aa  1936    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  49.77 
 
 		 1518 aa  1341    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  89.8 
 
 		 1510 aa  2737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  45.83 
 
 		 1478 aa  1300    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.09 
 
 		 1510 aa  1314    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  78.23 
 
 		 1507 aa  2368    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  49.6 
 
 		 1498 aa  1347    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.35 
 
 		 1505 aa  1314    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  45.71 
 
 		 1478 aa  1293    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.85 
 
 		 1519 aa  1371    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  73.29 
 
 		 1507 aa  2157    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  45.9 
 
 		 1478 aa  1301    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  46.98 
 
 		 1477 aa  1078    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  33.56 
 
 		 1484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  32.33 
 
 		 1542 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.84 
 
 		 1525 aa  556  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.09 
 
 		 1511 aa  550  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  33.02 
 
 		 1462 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  31.23 
 
 		 1482 aa  553  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  31.23 
 
 		 1482 aa  553  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  31.15 
 
 		 1482 aa  548  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  31.17 
 
 		 1482 aa  549  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.18 
 
 		 1482 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.55 
 
 		 1489 aa  546  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.46 
 
 		 1482 aa  546  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1481 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  30.9 
 
 		 1482 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 1482 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  31.2 
 
 		 1483 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  31.59 
 
 		 1482 aa  540  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  30.69 
 
 		 1487 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  30.84 
 
 		 1482 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  32.21 
 
 		 1489 aa  539  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  30.73 
 
 		 1487 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  31.68 
 
 		 1481 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 		 1462 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  32.16 
 
 		 1477 aa  535  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  30.54 
 
 		 1487 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.06 
 
 		 1482 aa  535  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  31.45 
 
 		 1462 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  31.29 
 
 		 1493 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  30.7 
 
 		 1507 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  31.28 
 
 		 1508 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.17 
 
 		 1482 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  31.49 
 
 		 1481 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1494 aa  530  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1536 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  30.54 
 
 		 1482 aa  529  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  31.31 
 
 		 1486 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  31.15 
 
 		 1486 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  31.9 
 
 		 1481 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.4 
 
 		 1486 aa  525  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  30.94 
 
 		 1481 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  31.4 
 
 		 1483 aa  526  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  31.73 
 
 		 1491 aa  526  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.98 
 
 		 1486 aa  526  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.92 
 
 		 1506 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.15 
 
 		 1483 aa  525  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  30.97 
 
 		 1482 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  32.04 
 
 		 1485 aa  523  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.01 
 
 		 1474 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  31.59 
 
 		 1482 aa  523  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 		 1554 aa  523  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  31.83 
 
 		 1481 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.81 
 
 		 1526 aa  523  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.23 
 
 		 1535 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.22 
 
 		 1518 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.78 
 
 		 1527 aa  522  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.87 
 
 		 1527 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.68 
 
 		 1509 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  31.69 
 
 		 1572 aa  520  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  31.44 
 
 		 1481 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.12 
 
 		 1501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  30.9 
 
 		 1488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.58 
 
 		 1574 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  30.93 
 
 		 1546 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.69 
 
 		 1572 aa  520  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  32.41 
 
 		 1480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.33 
 
 		 1577 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  30.45 
 
 		 1486 aa  515  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.21 
 
 		 1533 aa  516  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.91 
 
 		 1487 aa  516  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.38 
 
 		 1524 aa  516  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  29.36 
 
 		 1526 aa  511  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.07 
 
 		 1550 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  31.26 
 
 		 1535 aa  513  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  31.47 
 
 		 1481 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  31.26 
 
 		 1485 aa  513  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  31.19 
 
 		 1485 aa  512  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 		 1583 aa  512  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0946  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.14 
 
 		 1539 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.195752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>