More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0546 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  64.24 
 
 
501 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  62.75 
 
 
500 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  63.78 
 
 
509 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 
507 aa  1048    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  66.47 
 
 
502 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  62.5 
 
 
500 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.78 
 
 
509 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  84.98 
 
 
507 aa  904    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  63.31 
 
 
507 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.43 
 
 
502 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  65.16 
 
 
509 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  62.96 
 
 
500 aa  665    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  62.3 
 
 
497 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  63.31 
 
 
507 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  65.79 
 
 
501 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  86.36 
 
 
507 aa  921    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  69.06 
 
 
500 aa  725    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  58.24 
 
 
530 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  58.48 
 
 
510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  58.38 
 
 
510 aa  598  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.34 
 
 
503 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.38 
 
 
510 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  58.18 
 
 
510 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  57.17 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  57.37 
 
 
503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  57.61 
 
 
502 aa  571  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  57.17 
 
 
510 aa  568  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  54.95 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  56.97 
 
 
502 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.36 
 
 
712 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  42.43 
 
 
747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  48.91 
 
 
741 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.25 
 
 
693 aa  270  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  38.34 
 
 
681 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  38.74 
 
 
685 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  45.45 
 
 
684 aa  256  5e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.08 
 
 
1510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.15 
 
 
1519 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  40.5 
 
 
1546 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.83 
 
 
1533 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.95 
 
 
1554 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  38.79 
 
 
1530 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40 
 
 
1524 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  36.94 
 
 
1485 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.26 
 
 
1516 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  38.78 
 
 
1515 aa  224  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  37.97 
 
 
1516 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 
1469 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.05 
 
 
1505 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.34 
 
 
1512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  36.34 
 
 
1512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.11 
 
 
1487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  36.49 
 
 
1516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.12 
 
 
492 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  39.75 
 
 
1512 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  36.36 
 
 
1512 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  38.83 
 
 
1484 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.89 
 
 
1510 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  39.2 
 
 
1583 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  39.2 
 
 
1583 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.08 
 
 
1518 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.32 
 
 
1577 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  41.28 
 
 
1513 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  38.89 
 
 
1583 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 
1499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 
1499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  40.51 
 
 
1473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  38.51 
 
 
1478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.91 
 
 
1511 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  40.19 
 
 
1526 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  37.84 
 
 
1487 aa  217  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 
1572 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  40 
 
 
1572 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  40.19 
 
 
1482 aa  216  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  39.44 
 
 
1477 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  37.12 
 
 
1460 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  36.42 
 
 
1553 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  39.44 
 
 
1489 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  38.72 
 
 
1478 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.75 
 
 
1574 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  37.58 
 
 
1478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.62 
 
 
1574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.94 
 
 
1567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  37.88 
 
 
1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  37.88 
 
 
1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  37.88 
 
 
1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  37.76 
 
 
1477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  41.16 
 
 
1487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  37.88 
 
 
1478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  40.06 
 
 
1507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  39.56 
 
 
1533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 
1509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  37.88 
 
 
1478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  40.84 
 
 
1487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  38.35 
 
 
1574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.28 
 
 
1575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  37.03 
 
 
1482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.42 
 
 
1468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  38.41 
 
 
1478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  37.58 
 
 
1478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>