More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0559 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  65.26 
 
 
500 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  63.86 
 
 
509 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  65.26 
 
 
500 aa  698    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  66.14 
 
 
507 aa  681    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.65 
 
 
509 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.91 
 
 
507 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  72.46 
 
 
500 aa  766    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  73.75 
 
 
502 aa  780    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  72.26 
 
 
501 aa  768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  67.4 
 
 
502 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 
501 aa  1036    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  63.93 
 
 
497 aa  670    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  64.86 
 
 
509 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  66.14 
 
 
507 aa  681    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  65.26 
 
 
500 aa  697    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  64.24 
 
 
507 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  64.85 
 
 
507 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.49 
 
 
510 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  58.71 
 
 
510 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  59.69 
 
 
510 aa  615  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  59.49 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.34 
 
 
503 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  57.86 
 
 
503 aa  595  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  55.79 
 
 
530 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  56.55 
 
 
503 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  57.29 
 
 
502 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  57.14 
 
 
510 aa  568  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  55.78 
 
 
502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  54.55 
 
 
505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  44.6 
 
 
747 aa  324  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  50.6 
 
 
712 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.92 
 
 
741 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  40.94 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  40 
 
 
685 aa  283  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.03 
 
 
693 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  44.02 
 
 
684 aa  265  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.14 
 
 
1519 aa  249  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  44.03 
 
 
1516 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  44.03 
 
 
1516 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.33 
 
 
1572 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  42.33 
 
 
1572 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  39.39 
 
 
1507 aa  242  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  43.58 
 
 
1482 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  42.41 
 
 
1579 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.76 
 
 
1577 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  44 
 
 
1583 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  39.29 
 
 
1486 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  44 
 
 
1583 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  41.74 
 
 
1583 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  43.35 
 
 
1515 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  39.14 
 
 
1580 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  40.97 
 
 
1482 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.46 
 
 
1510 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.24 
 
 
1574 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  41.93 
 
 
1574 aa  240  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.44 
 
 
1512 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  43.67 
 
 
1554 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  41.08 
 
 
1546 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  43.24 
 
 
1482 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.09 
 
 
1483 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  42.61 
 
 
1564 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  41.95 
 
 
1482 aa  239  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  40.16 
 
 
1460 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  44.18 
 
 
1530 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  38.97 
 
 
1487 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.31 
 
 
1502 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  44.03 
 
 
1499 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.52 
 
 
1524 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  43.43 
 
 
1526 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  44.87 
 
 
1563 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.96 
 
 
1574 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  44.03 
 
 
1499 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.83 
 
 
1575 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  45.11 
 
 
1571 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  41.74 
 
 
1486 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.79 
 
 
1533 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  41.08 
 
 
1573 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  42.77 
 
 
1486 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  39.41 
 
 
1488 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  39 
 
 
1482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.2 
 
 
1574 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  43.5 
 
 
1477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  38.15 
 
 
1510 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  40.45 
 
 
1485 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  40.7 
 
 
1482 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  43.03 
 
 
1478 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  44.48 
 
 
1582 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  42.69 
 
 
1483 aa  236  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  42.77 
 
 
1485 aa  236  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  42.26 
 
 
1486 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  42.77 
 
 
1485 aa  236  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.89 
 
 
1505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.3 
 
 
1567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  42.34 
 
 
1462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  42.34 
 
 
1462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  40.7 
 
 
1482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  40.7 
 
 
1482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  42.34 
 
 
1482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  42.77 
 
 
1535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  38.46 
 
 
1487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>