More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2025 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  60.84 
 
 		 502 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 530 aa  1089    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  59.36 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  59.36 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  59.28 
 
 		 500 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  58.6 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  58.41 
 
 		 500 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  58.81 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  59.96 
 
 		 507 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  59.96 
 
 		 507 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  58.24 
 
 		 507 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  58.81 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  57.52 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  57.09 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.32 
 
 		 503 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  56.66 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  56.29 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  55.89 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  56.49 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.03 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  56.29 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  57.44 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  56.31 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.1 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.3 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  57.17 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  53.3 
 
 		 505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  55.98 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  54.97 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  52.4 
 
 		 747 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  50.75 
 
 		 712 aa  309  9e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.51 
 
 		 741 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  49.22 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  47.77 
 
 		 681 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  46.82 
 
 		 685 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  47.4 
 
 		 684 aa  257  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.85 
 
 		 1533 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  42.18 
 
 		 1554 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  40.4 
 
 		 1516 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  40.11 
 
 		 1516 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.41 
 
 		 1510 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  41.34 
 
 		 1546 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  42.94 
 
 		 1583 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  42.94 
 
 		 1583 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.84 
 
 		 1574 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  42.94 
 
 		 1583 aa  238  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.25 
 
 		 1483 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  40.06 
 
 		 1515 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  43.67 
 
 		 1567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  41.64 
 
 		 1524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.94 
 
 		 1505 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.64 
 
 		 1574 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  37.84 
 
 		 1487 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  39.48 
 
 		 1533 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  41.3 
 
 		 1477 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.41 
 
 		 1486 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.81 
 
 		 1519 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.99 
 
 		 1574 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  42.34 
 
 		 1573 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  39.4 
 
 		 1512 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.28 
 
 		 1502 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  40.36 
 
 		 1483 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  43.42 
 
 		 1507 aa  230  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  43.97 
 
 		 1487 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 1487 aa  230  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  42.34 
 
 		 1574 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  35.81 
 
 		 1553 aa  230  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  43.94 
 
 		 1571 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  41.36 
 
 		 1478 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5479  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.18 
 
 		 1526 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.07 
 
 		 1572 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.82 
 
 		 1509 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  38.84 
 
 		 1530 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  41.61 
 
 		 1478 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  41.27 
 
 		 1512 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.95 
 
 		 1511 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.73 
 
 		 1510 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  43.07 
 
 		 1572 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  41.27 
 
 		 1512 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  38.44 
 
 		 1487 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  36.41 
 
 		 1485 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 1486 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 1491 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.77 
 
 		 1577 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.94 
 
 		 1518 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.68 
 
 		 1469 aa  228  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.53 
 
 		 1584 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  40.56 
 
 		 1488 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  43.33 
 
 		 1564 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  38.64 
 
 		 1512 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  41.69 
 
 		 1580 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  41.3 
 
 		 1478 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.73 
 
 		 1578 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 1485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.87 
 
 		 1511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 1535 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 1485 aa  227  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2319  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.28 
 
 		 1524 aa  226  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.189899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  40 
 
 		 1487 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  37.5 
 
 		 1516 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>