More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2494 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  61.08 
 
 		 500 aa  656    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  91.36 
 
 		 509 aa  952    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  65.16 
 
 		 507 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  62.45 
 
 		 507 aa  649    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  64.46 
 
 		 500 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  62.45 
 
 		 507 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  64.86 
 
 		 501 aa  661    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  90.77 
 
 		 509 aa  928    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  64.24 
 
 		 507 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  61.92 
 
 		 500 aa  663    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  61.32 
 
 		 500 aa  657    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  62.2 
 
 		 502 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  63.29 
 
 		 501 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 509 aa  1048    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  60.12 
 
 		 497 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  67.74 
 
 		 502 aa  718    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  65.16 
 
 		 507 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  57.44 
 
 		 530 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  57.09 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  56.1 
 
 		 503 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  57.29 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  57.29 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  56.68 
 
 		 510 aa  579  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  55.42 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  55.22 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  55.44 
 
 		 503 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  56.28 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  54.73 
 
 		 502 aa  534  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  52.42 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.88 
 
 		 712 aa  322  7e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  50.43 
 
 		 747 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.79 
 
 		 741 aa  299  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  46.55 
 
 		 681 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  45.65 
 
 		 685 aa  283  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.61 
 
 		 693 aa  272  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  45.08 
 
 		 684 aa  257  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.93 
 
 		 1519 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.48 
 
 		 1510 aa  244  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.62 
 
 		 1505 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  38.74 
 
 		 1524 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  39.3 
 
 		 1546 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.09 
 
 		 1577 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  40.22 
 
 		 1554 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  43.12 
 
 		 1477 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.09 
 
 		 1572 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  41.09 
 
 		 1572 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  43.64 
 
 		 1478 aa  236  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.95 
 
 		 1574 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  40.86 
 
 		 1487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  43.9 
 
 		 1478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  39.32 
 
 		 1564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.26 
 
 		 1509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3616  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.11 
 
 		 1574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.103413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  39.59 
 
 		 1596 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  42.9 
 
 		 1488 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  39.82 
 
 		 1583 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  40.24 
 
 		 1574 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  41.05 
 
 		 1563 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  42.73 
 
 		 1478 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  43.6 
 
 		 1478 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  42.27 
 
 		 1478 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  42.73 
 
 		 1478 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  41.54 
 
 		 1571 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  40.37 
 
 		 1515 aa  233  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  39.94 
 
 		 1573 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  39.53 
 
 		 1583 aa  233  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  39.53 
 
 		 1583 aa  233  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 1482 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.9 
 
 		 1584 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.73 
 
 		 1578 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.99 
 
 		 1575 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  42.73 
 
 		 1478 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.81 
 
 		 1533 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 1535 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1138  glutamate synthase (ferredoxin)  39.18 
 
 		 1587 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 1485 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 1485 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  38.86 
 
 		 1516 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 1487 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  39.88 
 
 		 1567 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  41.57 
 
 		 1519 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  39.47 
 
 		 1580 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  40.31 
 
 		 1516 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  43.73 
 
 		 1482 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.04 
 
 		 1469 aa  231  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.69 
 
 		 1579 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 1460 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 1507 aa  231  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 1482 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.73 
 
 		 1573 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  39.15 
 
 		 1510 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  37.33 
 
 		 1485 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.76 
 
 		 1574 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  40.37 
 
 		 1516 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  38.99 
 
 		 1582 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 1487 aa  229  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 1477 aa  230  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>