More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0488 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  42.72 
 
 		 2126 aa  1132    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  44.83 
 
 		 1517 aa  1166    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.83 
 
 		 1517 aa  1166    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  42.01 
 
 		 1495 aa  1114    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 1481 aa  1170    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  44.87 
 
 		 1542 aa  1219    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2965  glutamate synthase (large subunit) oxidoreductase protein  43.55 
 
 		 1582 aa  1187    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  45.59 
 
 		 1553 aa  1226    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  44.08 
 
 		 1535 aa  1240    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  42.83 
 
 		 1486 aa  1149    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  42.01 
 
 		 1496 aa  1115    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  44.2 
 
 		 1583 aa  1211    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 1482 aa  1160    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  43.59 
 
 		 1481 aa  1166    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  41.63 
 
 		 1586 aa  1150    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  44.77 
 
 		 1571 aa  1232    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 1486 aa  1149    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2736  glutamate synthase, large subunit  43.47 
 
 		 1581 aa  1197    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  42.57 
 
 		 2135 aa  1125    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 1481 aa  1162    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 1487 aa  1150    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.37 
 
 		 1544 aa  1190    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.19 
 
 		 1520 aa  1152    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.89 
 
 		 1529 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.01 
 
 		 1600 aa  1197    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 1494 aa  1179    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  43.88 
 
 		 1596 aa  1191    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  44.28 
 
 		 1562 aa  1215    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  43.41 
 
 		 1648 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  44.41 
 
 		 1554 aa  1218    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 1481 aa  1172    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  82.16 
 
 		 1512 aa  2564    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  41.08 
 
 		 1473 aa  1024    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3499  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.93 
 
 		 1567 aa  1206    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  44.62 
 
 		 1533 aa  1207    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  43.82 
 
 		 1535 aa  1115    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  43.95 
 
 		 1533 aa  1179    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  44.12 
 
 		 1533 aa  1132    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3216  glutamate synthase, large subunit  43.47 
 
 		 1567 aa  1197    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  43.91 
 
 		 1493 aa  1142    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.77 
 
 		 1577 aa  1171    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.51 
 
 		 1479 aa  1065    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.78 
 
 		 1468 aa  1101    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  44.47 
 
 		 1536 aa  1189    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  64.06 
 
 		 1524 aa  1953    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3014  glutamate synthase, large subunit  43.47 
 
 		 1624 aa  1200    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.83 
 
 		 1535 aa  1214    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.76 
 
 		 1518 aa  1164    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  44.64 
 
 		 1579 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.11 
 
 		 1546 aa  1199    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  78.41 
 
 		 1511 aa  2477    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  42.48 
 
 		 1577 aa  1187    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  42.9 
 
 		 1481 aa  1109    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  44.17 
 
 		 1573 aa  1205    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.5 
 
 		 1580 aa  1198    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0365  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.18 
 
 		 1567 aa  1181    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 1482 aa  1156    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  44.57 
 
 		 1582 aa  1216    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 1483 aa  1129    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1138  glutamate synthase (ferredoxin)  44.04 
 
 		 1587 aa  1201    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 1487 aa  1139    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3263  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.02 
 
 		 1631 aa  1161    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3680  glutamate synthase (NADH) large subunit  45.85 
 
 		 1535 aa  1238    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2626  glutamate synthase (ferredoxin)  43.5 
 
 		 1585 aa  1197    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.77642  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  80.37 
 
 		 1510 aa  2517    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  60.94 
 
 		 1510 aa  1840    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2705  glutamate synthase (ferredoxin)  43.6 
 
 		 1659 aa  1202    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.15 
 
 		 1518 aa  1104    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.73 
 
 		 1527 aa  1147    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  45.42 
 
 		 1489 aa  1184    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 1488 aa  1141    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.8 
 
 		 1574 aa  1197    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3776  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.41 
 
 		 1512 aa  1237    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  45.05 
 
 		 1546 aa  1196    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  42.82 
 
 		 1482 aa  1162    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  42.82 
 
 		 1482 aa  1162    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 1491 aa  1150    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  43.05 
 
 		 1482 aa  1176    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0302  glutamate synthase (NADPH) large subunit  56.98 
 
 		 1509 aa  1682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.466931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0321  glutamate synthase (ferredoxin)  43.82 
 
 		 1567 aa  1202    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.917459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  43.79 
 
 		 1481 aa  1164    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.64 
 
 		 1489 aa  1103    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.92 
 
 		 1506 aa  1080    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.18 
 
 		 1519 aa  1127    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0402  glutamate synthase (ferredoxin)  43.8 
 
 		 1567 aa  1205    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0706  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.98 
 
 		 1512 aa  1212    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.985465  normal  0.0881297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  42.82 
 
 		 1482 aa  1162    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.36 
 
 		 1513 aa  1145    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  40.45 
 
 		 1465 aa  1039    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  44.9 
 
 		 1533 aa  1209    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  100 
 
 		 1516 aa  3132    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.15 
 
 		 1519 aa  1139    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  42.95 
 
 		 1483 aa  1176    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.15 
 
 		 1518 aa  1104    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.73 
 
 		 1527 aa  1147    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  42.74 
 
 		 1533 aa  1186    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  42.86 
 
 		 1518 aa  1123    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  42.73 
 
 		 1514 aa  1124    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  43.71 
 
 		 1482 aa  1167    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1008  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.49 
 
 		 1566 aa  1167    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>