More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0829 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  67.39 
 
 		 693 aa  895    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 681 aa  1360    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  86.93 
 
 		 685 aa  1222    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  67.25 
 
 		 684 aa  865    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  41.76 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  41 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  40.22 
 
 		 741 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.66 
 
 		 503 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  42.29 
 
 		 502 aa  294  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  43.03 
 
 		 502 aa  287  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  47.02 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  47.6 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  47.02 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  47.02 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  46.53 
 
 		 503 aa  279  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  46.43 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  43.03 
 
 		 497 aa  278  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  48.2 
 
 		 502 aa  278  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.27 
 
 		 501 aa  277  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  41.75 
 
 		 509 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  45.48 
 
 		 507 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  45.48 
 
 		 507 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  39.62 
 
 		 500 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.27 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  41.98 
 
 		 509 aa  271  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  45.35 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  43.24 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  38.34 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  47.77 
 
 		 530 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  46.55 
 
 		 509 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  39.53 
 
 		 502 aa  263  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  40.94 
 
 		 501 aa  260  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  38.56 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  38.56 
 
 		 500 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  45.24 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.92 
 
 		 500 aa  249  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.1 
 
 		 1510 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.99 
 
 		 1519 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.47 
 
 		 1505 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.94 
 
 		 1510 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  35.08 
 
 		 1479 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  33.88 
 
 		 1483 aa  184  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  34.95 
 
 		 1533 aa  183  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  38.11 
 
 		 1478 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  37.54 
 
 		 1507 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  34.68 
 
 		 1535 aa  183  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.66 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  37.3 
 
 		 1473 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  34.73 
 
 		 1562 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.96 
 
 		 1533 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  31.05 
 
 		 1499 aa  181  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  31.05 
 
 		 1499 aa  181  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  36.62 
 
 		 1487 aa  180  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.6 
 
 		 1513 aa  180  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  36.62 
 
 		 1487 aa  180  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 1481 aa  180  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  34.43 
 
 		 1461 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  35.11 
 
 		 1530 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  35.44 
 
 		 1494 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  33.18 
 
 		 1513 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.93 
 
 		 1511 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.89 
 
 		 1468 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  37.92 
 
 		 1477 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  35.58 
 
 		 1487 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  35.81 
 
 		 515 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 1482 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  178  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  178  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  34.17 
 
 		 1515 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  36.1 
 
 		 1524 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17041  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.1 
 
 		 1523 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  37.2 
 
 		 1478 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  36.42 
 
 		 1481 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  36.42 
 
 		 1481 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 1482 aa  177  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.29 
 
 		 1483 aa  176  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.59 
 
 		 1497 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  36.39 
 
 		 1480 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.68 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  38.02 
 
 		 1510 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 1481 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  37.31 
 
 		 1478 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  35.28 
 
 		 1487 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17161  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.28 
 
 		 1524 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  36.89 
 
 		 1478 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  34.17 
 
 		 1516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  34.09 
 
 		 1697 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.14 
 
 		 1527 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  35.11 
 
 		 1571 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 1481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  35.38 
 
 		 1546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  36 
 
 		 1487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.52 
 
 		 1474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  34.76 
 
 		 1481 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.82 
 
 		 1577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  36.66 
 
 		 1493 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  35.13 
 
 		 1516 aa  175  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>