More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3121 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.33 
 
 		 546 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 535 aa  1105    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.99 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.12 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.44 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  65.45 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.75 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.06 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  65.36 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  64.23 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.91 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.34 
 
 		 502 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  58.72 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.79 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  51.35 
 
 		 529 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  52.6 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  50.14 
 
 		 529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  43.98 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.06 
 
 		 492 aa  286  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  39.68 
 
 		 505 aa  207  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.77 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  36.81 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  36.81 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.22 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  36.5 
 
 		 510 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.25 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  36.22 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  35.33 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  38.21 
 
 		 507 aa  193  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  38.21 
 
 		 507 aa  193  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  38.41 
 
 		 502 aa  193  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.96 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  36.28 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  36.42 
 
 		 497 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  36.52 
 
 		 441 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.38 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.26 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  32.24 
 
 		 539 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  36.02 
 
 		 446 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.02 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.62 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  31.76 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  32 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  32 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  36.39 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.94 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.52 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.76 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  30.86 
 
 		 536 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.41 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  36.28 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.06 
 
 		 507 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  33.74 
 
 		 507 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.85 
 
 		 441 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  34.34 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  33.57 
 
 		 442 aa  183  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.26 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.82 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.68 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  34.59 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.68 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.08 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  30.82 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.29 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.52 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  30.82 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.26 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.76 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  37.79 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.11 
 
 		 442 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 		 447 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.61 
 
 		 448 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  31.41 
 
 		 507 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 		 553 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  31.6 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.29 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  35.29 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  37.2 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.48 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.58 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.48 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.48 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  35.53 
 
 		 510 aa  178  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.45 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  31.37 
 
 		 555 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.54 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  34.01 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.16 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.01 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  33.72 
 
 		 537 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.72 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  36.84 
 
 		 741 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.64 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  33.72 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.86 
 
 		 509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.68 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  33.72 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  33.72 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>