More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1804 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 440 aa  894    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.5 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  60.9 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.25 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  59.8 
 
 		 515 aa  485  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.44 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.93 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.55 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  57.88 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.48 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.79 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.28 
 
 		 545 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.39 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.3 
 
 		 547 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.44 
 
 		 529 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  43.71 
 
 		 529 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  46.21 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  42.32 
 
 		 496 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.65 
 
 		 492 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.67 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  35.65 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  34.67 
 
 		 510 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.37 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  34.37 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  31.23 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  33.62 
 
 		 510 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  36.33 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  36.33 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  35.67 
 
 		 505 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.81 
 
 		 507 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 		 507 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  35.38 
 
 		 510 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.43 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.92 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.14 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.67 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.43 
 
 		 500 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.7 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.71 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.27 
 
 		 500 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  31.9 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  31.78 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3469  glutamate synthase, large subunit  33.94 
 
 		 529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  30.1 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.17 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  34.36 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  35.41 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.41 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  35.74 
 
 		 503 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.13 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  32.15 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.31 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  32.54 
 
 		 600 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.5 
 
 		 547 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.65 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.03 
 
 		 536 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.67 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  32.22 
 
 		 536 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.85 
 
 		 527 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.78 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.01 
 
 		 496 aa  163  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0633  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.48 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  31.12 
 
 		 538 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  32.46 
 
 		 501 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  32.84 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  35.88 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  30.92 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 526 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 586 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 526 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 526 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  32.84 
 
 		 557 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.18 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  32.84 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  34.98 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.98 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.05 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.95 
 
 		 496 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.63 
 
 		 747 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3699  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 496 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0656612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.77 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.24 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.15 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0806  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.235708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  32.65 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  32.45 
 
 		 535 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.6 
 
 		 741 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3823  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.27 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3641  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.27 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.906462  normal  0.15864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  32.61 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.5 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.83 
 
 		 507 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.99 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0750  glutamate synthase, putative  32.96 
 
 		 496 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  32.85 
 
 		 553 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  32.65 
 
 		 539 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.54 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.93 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.3 
 
 		 547 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>