More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1229 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.69 
 
 		 547 aa  763    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 545 aa  1125    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.58 
 
 		 546 aa  748    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.12 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.83 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  53.02 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  57.64 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  55.61 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.65 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.87 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  55.88 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.17 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.03 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.28 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.08 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  47.95 
 
 		 529 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  49.45 
 
 		 529 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  45.88 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  43.75 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.75 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.43 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.15 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  41.03 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  41.03 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.23 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  38.3 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.49 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.64 
 
 		 437 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.49 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  39.74 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.19 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.58 
 
 		 447 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  39.74 
 
 		 441 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  38.46 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.59 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  37.17 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.97 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.59 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.42 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  37.38 
 
 		 502 aa  190  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  39.31 
 
 		 505 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.42 
 
 		 444 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.91 
 
 		 446 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.21 
 
 		 458 aa  190  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.91 
 
 		 446 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  37.91 
 
 		 446 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.75 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.21 
 
 		 442 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.59 
 
 		 503 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.03 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.97 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  36.75 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  34.16 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.59 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.51 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.95 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.21 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.72 
 
 		 446 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  37.59 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  34.64 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  37.8 
 
 		 502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  37.25 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  35.71 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  35.31 
 
 		 510 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  35.99 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.58 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  35.69 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  35.18 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  39.19 
 
 		 497 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.99 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  38.26 
 
 		 507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  37.59 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.9 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  33.82 
 
 		 510 aa  170  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  32.28 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.74 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.12 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.24 
 
 		 741 aa  163  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  31.84 
 
 		 555 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  31.84 
 
 		 555 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  31.84 
 
 		 556 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  31.7 
 
 		 539 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  31.7 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2041  glutamate synthase-related protein  30.64 
 
 		 525 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  31.41 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.27 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  31.56 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  31.7 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.01 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  31.7 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  31.41 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.82 
 
 		 712 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>