More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5751 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1658  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.58 
 
 		 447 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  79.32 
 
 		 440 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  79.21 
 
 		 446 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.58 
 
 		 458 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.39 
 
 		 446 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  96.15 
 
 		 442 aa  817    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.39 
 
 		 442 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.51 
 
 		 441 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.76 
 
 		 446 aa  691    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1573  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.13 
 
 		 448 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5640  ferredoxin-dependent glutamate synthase  96.15 
 
 		 442 aa  819    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0331257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.78 
 
 		 441 aa  707    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  83.14 
 
 		 441 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  85.81 
 
 		 444 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  100 
 
 		 442 aa  905    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  95.48 
 
 		 442 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  97.06 
 
 		 442 aa  826    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.91 
 
 		 445 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  82.8 
 
 		 444 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.67 
 
 		 441 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.99 
 
 		 444 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1940  ferredoxin-dependent glutamate synthase  84.58 
 
 		 447 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.57 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5263  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  76.36 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4895  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  76.36 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4984  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  76.36 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.16 
 
 		 447 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1297  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75.17 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.361733  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  68.46 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  69 
 
 		 460 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0169  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.5 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1701  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.13 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  37.38 
 
 		 529 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.69 
 
 		 496 aa  236  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  36.56 
 
 		 492 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  35.23 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.46 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.63 
 
 		 529 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  34.82 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  35.52 
 
 		 529 aa  223  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.43 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.57 
 
 		 535 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  38.02 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  35.02 
 
 		 510 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  37.75 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.02 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  35.27 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.64 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.89 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  33.89 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.1 
 
 		 503 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  35.14 
 
 		 505 aa  210  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.49 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  34.4 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.75 
 
 		 501 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.49 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  32.7 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.29 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  36.76 
 
 		 507 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  36.76 
 
 		 507 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  32.33 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  33.1 
 
 		 507 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  33.5 
 
 		 502 aa  202  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  32.62 
 
 		 507 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.14 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  32.13 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.1 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  32.13 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32.07 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.9 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.71 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  33.01 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.59 
 
 		 509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.65 
 
 		 546 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.11 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.922442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2083  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.49 
 
 		 547 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.12 
 
 		 509 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4363  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.76 
 
 		 466 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  32.77 
 
 		 510 aa  176  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.13 
 
 		 747 aa  160  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.3 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.58 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.43 
 
 		 741 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.74 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.05 
 
 		 712 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.15 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.03 
 
 		 581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.26 
 
 		 524 aa  146  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.76 
 
 		 693 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  30.6 
 
 		 539 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.27 
 
 		 526 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  29.28 
 
 		 600 aa  143  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.9 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  30.83 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  31.9 
 
 		 685 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  32.42 
 
 		 681 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.8 
 
 		 1510 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  29.41 
 
 		 670 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>